“對(duì)我而言，回答了自己心中的問題或者做出一個(gè)新的發(fā)現(xiàn)，這種成就感要遠(yuǎn)高于生活中的其他快樂。”李婧翌對(duì)《麻省理工科技評(píng)論》中國這樣說道。

而她的研究?jī)?nèi)容在很多人眼里或許稍顯枯燥：針對(duì)前沿的生物學(xué)問題開發(fā)新的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法，尤其著重于對(duì)大規(guī)模基因組和轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行分析方法的開發(fā)。

由于高通量實(shí)驗(yàn)技術(shù)的發(fā)展，生命科學(xué)從一個(gè)靠觀察實(shí)驗(yàn)為主的學(xué)科逐漸變得更加需要定量化，而這些大規(guī)模數(shù)據(jù)的產(chǎn)生也需要算法才能夠進(jìn)行分析，從而總結(jié)出數(shù)學(xué)規(guī)律并用規(guī)律來刻畫事物的本質(zhì)。

加州大學(xué)洛杉磯分校（UCLA）統(tǒng)計(jì)系（已獲得終身教職）副教授和博士生導(dǎo)師，生物統(tǒng)計(jì)系、人類遺傳學(xué)系和計(jì)算醫(yī)學(xué)系博士生導(dǎo)師李婧翌認(rèn)為，生命科學(xué)作為一個(gè)“宏科學(xué)”，盡管問題的本質(zhì)與生命強(qiáng)相關(guān)，但研究手段需要各個(gè)學(xué)科一起合作，計(jì)算則是其中非常重要的一部分，大數(shù)據(jù)也需要有非常適合的挖掘工具，這對(duì)于從小對(duì)數(shù)學(xué)與科學(xué)有強(qiáng)烈興趣、并在本科與博士階段分別接受了生命科學(xué)與生物統(tǒng)計(jì)學(xué)系統(tǒng)教育的李婧翌有強(qiáng)大的吸引。

李婧翌的研究專注于統(tǒng)計(jì)學(xué)與生命科學(xué)的交叉問題，她首創(chuàng)性地使用嚴(yán)格的統(tǒng)計(jì)學(xué)來分析已發(fā)表的轉(zhuǎn)錄組學(xué)和蛋白組學(xué)數(shù)據(jù)，發(fā)現(xiàn)在過往研究中，由于研究人員對(duì)測(cè)量誤差的忽略，轉(zhuǎn)錄的重要性被嚴(yán)重低估，該分析挑戰(zhàn)了“翻譯比轉(zhuǎn)錄重要”的觀點(diǎn)卻支持了之前大量在 mRNA 轉(zhuǎn)錄水平的科學(xué)發(fā)現(xiàn)。因其重要性，李婧翌的研究結(jié)果被發(fā)表在 Science 雜志并收錄于本科教材 Molecular Cell Biology 中。

圖 | 左圖是論文 B.Schwanh?usseretal.,Nature473,337(2011) 中在不考慮實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)誤差的情況下對(duì)轉(zhuǎn)錄、翻譯、mRNA 降解和蛋白質(zhì)降解這四個(gè)步驟對(duì)于蛋白質(zhì)含量的貢獻(xiàn)的估計(jì)；右圖是在校正了實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)誤差之后的估計(jì)。（來源：李婧翌的論文 Li et al. (2015). Statistics requantitates the central dogma. Science347(6226):1066-1067.）

此外，李婧翌團(tuán)隊(duì)還開發(fā)了大量生物信息學(xué)工具在組織和單細(xì)胞水平上對(duì) mRNA 分子進(jìn)行全系統(tǒng)測(cè)量，并正在開發(fā)一項(xiàng)能夠?qū)ふ业饺巳簛喰椭泻图膊∠嚓P(guān)的基因變異的新的統(tǒng)計(jì)度量。

憑借上述優(yōu)異的研究成果，李婧翌成功入選 《麻省理工科技評(píng)論》“35 歲以下科技創(chuàng)新 35 人”（Innovators Under 35）2020 年中國區(qū)榜單。

圖 |《麻省理工科技評(píng)論》“35 歲以下科技創(chuàng)新 35 人”2020 年中國區(qū)榜單入選者李婧翌

無心插柳，卻顛覆固有認(rèn)知

早在 1958 年，中心轉(zhuǎn)錄法則便被提出，它指的是遺傳信息被編碼在 DNA 中，通過轉(zhuǎn)錄會(huì)變成 mRNA，再通過翻譯的過程變成蛋白質(zhì)，這是所有有細(xì)胞結(jié)構(gòu)的生物所遵循的法則。 在這個(gè)過程中，除了轉(zhuǎn)錄和翻譯生成了 mRNA 和蛋白質(zhì)這兩個(gè)步驟，還存在 mRNA 和蛋白質(zhì)的降解，這四個(gè)步驟共同決定了每一個(gè)基因所對(duì)應(yīng)的蛋白質(zhì)到底在我們細(xì)胞中存在多少量。不過，此前中心轉(zhuǎn)錄法則是一個(gè)定性表述，“沒有人知道每一步的速率是多少，也沒有人知道對(duì)最后蛋白質(zhì)含量的影響有多少。” 在李婧翌博士即將畢業(yè)之時(shí)，她與合作者 Mark Biggin 博士共同研究中心轉(zhuǎn)錄法則的定量工作。偶然的一次機(jī)會(huì)，李婧翌和合作者發(fā)現(xiàn)，2011 年發(fā)表在Nature上的一篇文章首次在小鼠的全基因組的基因中進(jìn)行了 4 項(xiàng)步驟的測(cè)量，其得出的結(jié)論是每個(gè)基因的 mRNA 的含量對(duì)于蛋白質(zhì)含量的預(yù)測(cè)效果比較差，也就是說一個(gè)基因內(nèi) mRNA 的高或低并不太能代表它的蛋白質(zhì)含量的高或低。 “這在當(dāng)時(shí)是個(gè)非常讓人震驚的結(jié)論。因?yàn)槲覀冇泻芏鄬?shí)驗(yàn)手段可以用來研究 mRNA，但是研究蛋白質(zhì)相對(duì)困難很多，所以大量生物學(xué)的發(fā)現(xiàn)成果都圍繞 mRNA 的含量水平。如果這篇文章的結(jié)果為真，那么之前很多 mRNA 的結(jié)果可能都沒有什么意義了。”李婧翌解釋道。 當(dāng)李婧翌與合作伙伴看到這篇文章時(shí)，他們觀察到這項(xiàng)工作是將高通量質(zhì)譜轉(zhuǎn)化為蛋白質(zhì)含量，但在轉(zhuǎn)化過程中，它的標(biāo)準(zhǔn)實(shí)際上只基于高表達(dá)蛋白，并假設(shè)同樣的轉(zhuǎn)換方式也適用于低表達(dá)蛋白，由此導(dǎo)致了研究里面很多低表達(dá)蛋白的表達(dá)指征是很不準(zhǔn)的，也就意味著高通量蛋白質(zhì)測(cè)量很有可能存在誤差。 為了解決這一疑惑，李婧翌將實(shí)驗(yàn)誤差考慮進(jìn)建模后發(fā)現(xiàn)，實(shí)際上 mRNA 和蛋白質(zhì)含量的相關(guān)性比 Nature 的文章報(bào)道的要高很多，轉(zhuǎn)錄的重要性被嚴(yán)重低估。這項(xiàng)“無心插柳”的研究結(jié)果被發(fā)表在 Science 雜志并收錄于本科教材 Molecular Cell Biology 中。 李婧翌對(duì)《麻省理工科技評(píng)論》中國回憶道：“我覺得很有趣的一點(diǎn)是，我們將很基本的統(tǒng)計(jì)方法用到了正確的問題上，從而發(fā)現(xiàn)了非常意想不到的結(jié)果。這也說明了考慮數(shù)據(jù)測(cè)量的隨機(jī)性和數(shù)據(jù)噪音對(duì)科學(xué)結(jié)論十分重要。”這一年，李婧翌還不到 30 歲。科研與教育同樣重要 作為一個(gè)青年科學(xué)家，李婧翌認(rèn)為，保持對(duì)未知問題的好奇心，用研究拓寬人類的知識(shí)邊界，是支撐她科研工作的重要推動(dòng)力。 作為一個(gè)科研人員，李婧翌認(rèn)為目前的統(tǒng)計(jì)分析還遠(yuǎn)遠(yuǎn)談不上科學(xué)，“如果一個(gè)分析人員在寫研究報(bào)告時(shí)沒有記錄分析的每一步，而只是簡(jiǎn)略地記錄一個(gè)結(jié)果，那最終結(jié)果就不太透明，并且可能也不能被重復(fù)，可信度就要大打折扣。” 此外，李婧翌提到，如果要將最新研究的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法發(fā)表在比較好的學(xué)術(shù)雜志上，通常情況下做的越復(fù)雜越容易發(fā)表，這就導(dǎo)致統(tǒng)計(jì)學(xué)領(lǐng)域出現(xiàn)一個(gè)通病：很多統(tǒng)計(jì)方法都比較像“黑箱”，它們過于復(fù)雜，也沒有給實(shí)際應(yīng)用的人員講授清楚優(yōu)缺點(diǎn)到底在哪里。

圖 | 對(duì)于同樣的一套多個(gè)病人樣本中的基因表達(dá)數(shù)據(jù)，病人是觀測(cè)值，而基因是特征。大部分的病人已知得病或未得病。如果研究問題是：基因A是否為一個(gè)有效的疾病標(biāo)志物，那么假設(shè)檢驗(yàn)是合適的統(tǒng)計(jì)方法。而如果研究問題是：1號(hào)病人是否得病，那么二元分類是合適的統(tǒng)計(jì)方法。（來源：李婧翌的論文Li et al. (2020). Statistical hypothesis testing versus machine-learning binary classification: distinctions and guidelines. Patterns 1(7):110115.）

作為一個(gè)有交叉學(xué)科背景的研究人員，李婧翌充分利用了這一點(diǎn)：能夠更好地讓生命科學(xué)領(lǐng)域的數(shù)據(jù)分析人員去理解現(xiàn)有的一些經(jīng)典方法的優(yōu)缺點(diǎn)和適用范圍，同時(shí)，李婧翌自己發(fā)展新方法也將以此為目標(biāo)，創(chuàng)造出更透明、更穩(wěn)定的統(tǒng)計(jì)學(xué)方法。舉例而言，李婧翌在最近發(fā)表的一篇文章中就嘗試對(duì)兩種常用但經(jīng)常被混淆的統(tǒng)計(jì)方法：假設(shè)檢驗(yàn)和二元分類，進(jìn)行解釋并闡述這兩種方法各自適用的數(shù)據(jù)分析問題。譬如對(duì)致癌基因和抑癌基因的預(yù)測(cè)問題，李婧翌解釋了為什么基于現(xiàn)有的大數(shù)據(jù)，二元分類是一個(gè)更加適用的統(tǒng)計(jì)方法。 作為教師，李婧翌致力于將統(tǒng)計(jì)方法開發(fā)和實(shí)際應(yīng)用的重要性更緊密的結(jié)合。 李婧翌認(rèn)為，無論中美，目前統(tǒng)計(jì)學(xué)的基礎(chǔ)教育中都有很多過時(shí)的教學(xué)內(nèi)容，因?yàn)楹芏嘤?jì)算都已經(jīng)可以依靠計(jì)算機(jī)的程序包來進(jìn)行自動(dòng)化運(yùn)算。統(tǒng)計(jì)學(xué)教育更重要的應(yīng)該是去教授學(xué)生為什么需要統(tǒng)計(jì)學(xué)，數(shù)據(jù)背后的隨機(jī)性應(yīng)該怎么去理解，以及數(shù)據(jù)分析到底想解決什么問題，“我覺得這些其實(shí)是統(tǒng)計(jì)教育需要改變的的東西，我希望我能夠發(fā)揮一些作用。”

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