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如何解決數(shù)據(jù)庫(kù)CPU使用率100%報(bào)警頻繁的問(wèn)題呢

工程師鄧生 ? 來(lái)源:OSCHINA 社區(qū) ? 作者:京東云開(kāi)發(fā)者 ? 2022-09-01 12:12 ? 次閱讀

1 前言

近期隨著數(shù)據(jù)量的增長(zhǎng),數(shù)據(jù)庫(kù) CPU 使用率 100% 報(bào)警頻繁起來(lái)。第一個(gè)想到的就是慢 Sql,我們對(duì)未合理運(yùn)用索引的表加入索引后,問(wèn)題依然沒(méi)有得到解決,深入排查時(shí),發(fā)現(xiàn)在 order by id asc limit n 時(shí),即使 where 條件已經(jīng)包含了覆蓋索引,優(yōu)化器還是選擇了錯(cuò)誤的索引導(dǎo)致。通過(guò)查詢大量資料,問(wèn)題得到了解決。這里將解決問(wèn)題的思路以及排查過(guò)程分享出來(lái),如果有錯(cuò)誤歡迎指正。

2 正文

2.1 環(huán)境介紹

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2.2 發(fā)現(xiàn)問(wèn)題

22 日開(kāi)始,收到以下圖 1 報(bào)警變得頻繁起來(lái),由于數(shù)據(jù)庫(kù)中會(huì)有大數(shù)據(jù)推數(shù)動(dòng)作,數(shù)據(jù)庫(kù) CPU 偶爾報(bào)警并沒(méi)有引起對(duì)該問(wèn)題的重視,直到通過(guò)圖 2 對(duì)整日監(jiān)控?cái)?shù)據(jù)分析時(shí),才發(fā)現(xiàn)問(wèn)題的嚴(yán)重性,從 0 點(diǎn)開(kāi)始,數(shù)據(jù)庫(kù) CPU 頻繁被打滿。

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圖 1:報(bào)警圖

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圖 2:整日 CPU 監(jiān)控圖

2.3 排查問(wèn)題

發(fā)現(xiàn)問(wèn)題后,開(kāi)始排查慢 Sql,發(fā)現(xiàn)很多查詢未添加合適的索引,經(jīng)過(guò)一輪修復(fù)后,問(wèn)題依然沒(méi)有得到解決,在深入排查時(shí)發(fā)現(xiàn)了一個(gè)奇怪現(xiàn)象,SQL 代碼如下(表名已經(jīng)替換),比較簡(jiǎn)單的一個(gè)單表查詢語(yǔ)句。

poYBAGMQMVOAOpvtAABHrDwPvaU298.jpg

看似比較簡(jiǎn)單的查詢,但執(zhí)行時(shí)長(zhǎng)平均在 90s 以上,并且調(diào)用頻次較高。如圖 3 所示。
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圖 3:慢 Sql 平均執(zhí)行時(shí)長(zhǎng) 開(kāi)始檢查表信息,可以看到表數(shù)據(jù)量在 2100w 左右。

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圖 4:數(shù)據(jù)表情況 排查索引情況,主鍵為 id,并且有 business_day 與 full_ps_code 的聯(lián)合索引。

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通過(guò) Explain 查看執(zhí)行計(jì)劃時(shí)發(fā)現(xiàn),possible_keys 中包含上面的聯(lián)合索引,而 Key 卻選擇了 Primary 主鍵索引,掃描行數(shù) Rows 為 1700w,幾乎等于全表掃描。 697ffca8-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png 圖 5:執(zhí)行計(jì)劃情況

2.4 解決問(wèn)題

第一次,我們分析是,由于 Where 條件中包含了 ID,查詢分析器認(rèn)為主鍵索引掃描行數(shù)會(huì)少,同時(shí)根據(jù)主鍵排序,使用主鍵索引會(huì)更加合理,我們?cè)囍砑右韵滤饕胍尣樵兎治銎髅形覀冃录拥乃饕?/p>

ADD INDEX `idx_test`(`business_day`, `full_ps_code`, `id`) USING BTREE;
再次通過(guò) Explain 語(yǔ)句進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)執(zhí)行計(jì)劃完全沒(méi)變,還是走的主鍵索引。

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圖 6:執(zhí)行計(jì)劃情況 第二次,我們通過(guò)強(qiáng)制指定索引方式 force index (idx_test) 方式,再次分析執(zhí)行情況,得到圖 7 的結(jié)果,同樣的查詢條件同樣的結(jié)果,查詢時(shí)長(zhǎng)由 90s->0.49s 左右。問(wèn)題得到解決

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圖 7:強(qiáng)制指定索引后執(zhí)行計(jì)劃情況

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第三次,我們懷疑是 where 條件中有 ID 導(dǎo)致直接走的主鍵索引,where 條件中去掉 id,Sql 調(diào)整如下,然后進(jìn)行分析。依然沒(méi)有命中索引,掃描 rows 變成 111342,查詢時(shí)間 96s

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第四次,我們把 order by 去掉,SQL 調(diào)整如下,然后進(jìn)行分析。命中了 idx_business_day_full_ps_code 之前建立的聯(lián)合索引。掃描行數(shù)變成 154900,查詢時(shí)長(zhǎng)變?yōu)?0.062s,但是發(fā)現(xiàn)結(jié)果與預(yù)想的不一致,發(fā)生了亂序

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第五次,經(jīng)過(guò)前幾次的分析可以確定,order by 導(dǎo)致查詢分析器選擇了主鍵索引,我們?cè)?Order by 中增加排序字段,將 Sql 調(diào)整如下,同樣可以命中我們之前的聯(lián)合索引,查詢時(shí)長(zhǎng)為 0.034s,由于先按照主鍵排序,結(jié)果是一致的。相比第四種方法多了一份 filesort,問(wèn)題得解決。

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第六次,我們考慮是不是 Limit 導(dǎo)致的問(wèn)題,我們將 Limit 500 調(diào)整到 1000,Sql 調(diào)整如下,奇跡發(fā)生了,命中了聯(lián)合索引,查詢時(shí)長(zhǎng)為 0.316s,結(jié)果一致,只不過(guò)多返回來(lái) 500 條數(shù)據(jù)。問(wèn)題得到了解決。經(jīng)過(guò)多次實(shí)驗(yàn) Limit 大于 695 時(shí)就會(huì)命中聯(lián)合索引,查詢條件下的數(shù)據(jù)量是 79963,696/79963 大概占比是 0.0087,猜測(cè)當(dāng)獲取數(shù)據(jù)比超過(guò) 0.0087 時(shí),會(huì)選擇聯(lián)合索引,未找到源代碼驗(yàn)證此結(jié)論。

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經(jīng)過(guò)我們的驗(yàn)證,其中第 2、5、6 三種方法都可以解決性能問(wèn)題。為了不影響線上,我們立即修改代碼,并選擇了 force index 的方式,上線觀察一段時(shí)間后,數(shù)據(jù)庫(kù) CPU 恢復(fù)正常,問(wèn)題得到了解決。

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3 事后分析

上線后問(wèn)題得到了解決,同時(shí)也留給我了很多疑問(wèn)。

為什么明明 where 條件中包含了聯(lián)合索引,卻未能命中,反而選擇了性能較慢的主鍵索引?

為什么在 order by 中增加了一個(gè)索引其他字段,就可以命中聯(lián)合索引了呢?

為什么我僅僅是將 limit 限制條件由原來(lái)的 500 調(diào)大后,也能命中聯(lián)合索引呢?

這一切的答案都來(lái)自 MySQL 的查詢優(yōu)化器。

3.1 查詢優(yōu)化器

查詢優(yōu)化器是專門負(fù)責(zé)優(yōu)化查詢語(yǔ)句的優(yōu)化器模塊,通過(guò)計(jì)算分析收集的各種系統(tǒng)統(tǒng)計(jì)信息,為查詢給出最優(yōu)的執(zhí)行計(jì)劃 —— 最優(yōu)的數(shù)據(jù)檢索方式。 優(yōu)化器決定如何執(zhí)行查詢的方式是基于一種稱為基于代價(jià)的優(yōu)化的方法。5.7 在代價(jià)類型上分為 IO、CPU、Memory。內(nèi)存的代價(jià)收集了,但是并沒(méi)有參與最終的代價(jià)計(jì)算。Mysql 中引入了兩個(gè)系統(tǒng)表,mysql.server_cost 和 mysql.engine_cost,server_cost 對(duì)應(yīng) CPU 的代價(jià),engine_cost 代表 IO 的代價(jià)。 server_cost(CPU 代價(jià))

row_evaluate_cost (default 0.2) 計(jì)算符合條件的行的代價(jià),行數(shù)越多,此項(xiàng)代價(jià)越大

memory_temptable_create_cost (default 2.0) 內(nèi)存臨時(shí)表的創(chuàng)建代價(jià)

memory_temptable_row_cost (default 0.2) 內(nèi)存臨時(shí)表的行代價(jià)

key_compare_cost (default 0.1) 鍵比較的代價(jià),例如排序

disk_temptable_create_cost (default 40.0) 內(nèi)部 myisam 或 innodb 臨時(shí)表的創(chuàng)建代價(jià)

disk_temptable_row_cost (default 1.0) 內(nèi)部 myisam 或 innodb 臨時(shí)表的行代價(jià)

由上可以看出創(chuàng)建臨時(shí)表的代價(jià)是很高的,尤其是內(nèi)部的 myisam 或 innodb 臨時(shí)表。 engine_cost(IO 代價(jià))

io_block_read_cost (default 1.0) 從磁盤讀數(shù)據(jù)的代價(jià),對(duì) innodb 來(lái)說(shuō),表示從磁盤讀一個(gè) page 的代價(jià)

memory_block_read_cost (default 1.0) 從內(nèi)存讀數(shù)據(jù)的代價(jià),對(duì) innodb 來(lái)說(shuō),表示從 buffer pool 讀一個(gè) page 的代價(jià)

這些信息都可以在數(shù)據(jù)庫(kù)中配置,當(dāng)數(shù)據(jù)庫(kù)中未配置時(shí),從 MySql 源代碼(5.7)中可以看到以上默認(rèn)值情況

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3.2 代價(jià)配置

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3.3 代價(jià)計(jì)算

代價(jià)是如何算出來(lái)的呢,通過(guò)讀 MySql 的源代碼,可以找到最終的答案 3.3.1 全表掃描(table_scan_cost) 以下代碼摘自 MySql Server(5.7 分支),全表掃描時(shí),IO 與 CPU 的代價(jià)計(jì)算方式。

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根據(jù)源代碼分析,當(dāng)表中包含 100 行數(shù)據(jù)時(shí),全表掃描的成本為 23.1,計(jì)算邏輯如下

poYBAGMQN52AMqygAABZDU0N6c8455.jpg

驗(yàn)證結(jié)果如下圖

6ad746ba-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

3.3.2 索引掃描(index_scan_cost) 以下代碼摘自 MySql Server(5.7 分支),當(dāng)出現(xiàn)索引掃描時(shí),是如何進(jìn)行計(jì)算的,核心代碼如下

pYYBAGMQN8iAKhoGAABfHEGQbbs544.jpg

io 代價(jià)計(jì)算核心代碼

//核心代碼
const double io_cost= index_only_read_time(index, rows) *
table->cost_model()->page_read_cost_index(index, 1.0);

// index_only_read_time(index, rows)
// 估算index占page個(gè)數(shù)

//page_read_cost_index(index, 1.0)
//根據(jù)buffer pool大小和索引大小來(lái)估算page in memory和in disk的比例,計(jì)算讀一個(gè)page的代價(jià)

cpu 代價(jià)計(jì)算核心代碼

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3.3.3 其他方式 計(jì)算代價(jià)的方式有很多,其他方式請(qǐng)參考 MySql 原代碼。https://github.com/mysql/mysql-server.git

3.4 深度解析

通過(guò)查看 optimizer_trace,可以了解查詢優(yōu)化器是如何選擇的索引。

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通過(guò)分析 rows_estimation 節(jié)點(diǎn),可以看到通過(guò)全表掃描(table_scan)的話的代價(jià)是 8.29e6,同時(shí)也可以看到該查詢可以選擇到主鍵索引與聯(lián)合索引,如下圖。

6af7ba26-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

上圖中全表掃描的代價(jià)是 8.29e6,我們轉(zhuǎn)換成普通計(jì)數(shù)法為 8290000,如果使用主鍵索引成本是 3530000,聯(lián)合索引 185881,最小的應(yīng)該是 185881 聯(lián)合索引,也可以看到第一步通過(guò)成本分析確實(shí)選擇了我們的聯(lián)合索引。

6b1a2052-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

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但是為什么還是選擇了主鍵索引呢? 通過(guò)往下看,在 reconsidering_access_paths_for_index_ordering 節(jié)點(diǎn)下, 發(fā)現(xiàn)由于 Order by 導(dǎo)致重新選擇了索引,在下圖中可以看到主鍵索引可用(usable=true),我們的聯(lián)合索引為 not_applicable (不適用),意味著排序只能使用主鍵索引。

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接下來(lái)通過(guò) index_order_summary 可以看出,執(zhí)行計(jì)劃最終被調(diào)整,由原來(lái)的聯(lián)合索引改成了主鍵索引,就是說(shuō)這個(gè)選擇無(wú)視了之前的基于索引成本的選擇。

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為什么會(huì)有這樣的一個(gè)選項(xiàng)呢,主要原因如下:

The short explanation is that the optimizer thinks — or should I say hopes — that scanning the whole table (which is already sorted by the id field) will find the limited rows quick enough, and that this will avoid a sort operation. So by trying to avoid a sort, the optimizer ends-up losing time scanning the table.

從這段解釋可以看出主要原因是由于我們使用了 order by id asc 這種基于 id 的排序?qū)懛ǎ瑑?yōu)化器認(rèn)為排序是個(gè)昂貴的操作,所以為了避免排序,并且它認(rèn)為 limit n 的 n 如果很小的話即使使用全表掃描也能很快執(zhí)行完,所以它選擇了全表掃描,也就避免了 id 的排序。

5 總結(jié)

查詢優(yōu)化器會(huì)基于代價(jià)來(lái)選擇最優(yōu)的執(zhí)行計(jì)劃,但由于 order by id limit n 的存在,MySql 可能會(huì)重新選擇一個(gè)錯(cuò)誤的索引,忽略原有的基于代價(jià)選擇出來(lái)的索引,轉(zhuǎn)而選擇全表掃描的主鍵索引。這個(gè)問(wèn)題在國(guó)內(nèi)外有大量的用戶反饋,BUG 地址https://bugs.mysql.com/bug.php?id=97001。官方稱在 5.7.33 以后版本可以關(guān)閉 prefer_ordering_index 來(lái)解決。如下圖所示。

6ba69b36-292c-11ed-ba43-dac502259ad0.png

另外在我們?nèi)粘B?Sql 調(diào)優(yōu)時(shí),可以通過(guò)以下兩種方式,了解更多查詢優(yōu)化器選擇過(guò)程。

poYBAGMQOFyAZk2CAACQfGRgS0c916.jpg

當(dāng)你也出現(xiàn)了本篇文章碰到的問(wèn)題時(shí),可以采用以下的方法來(lái)解決

使用 force index,強(qiáng)制指定索引。

order by 中增加一個(gè)聯(lián)合索引的 key。

擴(kuò)大 limit 返回的范圍(不推薦,隨著數(shù)據(jù)量的增大,可能還會(huì)走回主鍵索引)

order by (id+0) asc 欺騙查詢優(yōu)化器,讓其選擇聯(lián)合索引。

MySQL 5.7.33 版本以上,可以關(guān)閉 prefer_ordering_index 解決。



審核編輯:劉清

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原文標(biāo)題:記錄一次數(shù)據(jù)庫(kù)CPU被打滿的排查過(guò)程

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    數(shù)據(jù)庫(kù)是一種部署在虛擬計(jì)算環(huán)境中的數(shù)據(jù)庫(kù),它融合了云計(jì)算的彈性和可擴(kuò)展性,為用戶提供高效、靈活的數(shù)據(jù)庫(kù)服務(wù)。云數(shù)據(jù)庫(kù)主要分為兩大類:關(guān)系型數(shù)據(jù)庫(kù)
    的頭像 發(fā)表于 01-07 10:22 ?348次閱讀

    數(shù)據(jù)庫(kù)加密辦法

    企業(yè)對(duì)于數(shù)據(jù)的重視程度不言而喻,也衍生出了數(shù)據(jù)=資產(chǎn)的概念。但是數(shù)據(jù)泄漏的事件頻繁發(fā)生,為了保護(hù)數(shù)據(jù)資產(chǎn),企業(yè)有必要對(duì)
    的頭像 發(fā)表于 12-24 09:47 ?453次閱讀

    數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)恢復(fù)—Mysql數(shù)據(jù)庫(kù)表記錄丟失的數(shù)據(jù)恢復(fù)流程

    Mysql數(shù)據(jù)庫(kù)故障: Mysql數(shù)據(jù)庫(kù)表記錄丟失。 Mysql數(shù)據(jù)庫(kù)故障表現(xiàn): 1、Mysql數(shù)據(jù)庫(kù)表中無(wú)任何數(shù)據(jù)或只有部分
    的頭像 發(fā)表于 12-16 11:05 ?464次閱讀
    <b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b><b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>恢復(fù)—Mysql<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b>表記錄丟失的<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>恢復(fù)流程

    數(shù)據(jù)庫(kù)事件觸發(fā)的設(shè)置和應(yīng)用

    數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)論對(duì)于生產(chǎn)管理還是很多的實(shí)際應(yīng)用都非常重要。小編這次聊一下數(shù)據(jù)庫(kù)事件觸發(fā)的應(yīng)用。示例使用了postgresql和Python。
    的頭像 發(fā)表于 12-13 15:14 ?489次閱讀

    數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)恢復(fù)—MYSQL數(shù)據(jù)庫(kù)ibdata1文件損壞的數(shù)據(jù)恢復(fù)案例

    mysql數(shù)據(jù)庫(kù)故障: mysql數(shù)據(jù)庫(kù)文件ibdata1、MYI、MYD損壞。 故障表現(xiàn):1、數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)法進(jìn)行查詢等操作;2、使用mysqlcheck和myisamchk無(wú)法修復(fù)數(shù)據(jù)庫(kù)
    的頭像 發(fā)表于 12-09 11:05 ?449次閱讀

    數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)恢復(fù)—通過(guò)拼接數(shù)據(jù)庫(kù)碎片恢復(fù)SQLserver數(shù)據(jù)庫(kù)

    一個(gè)運(yùn)行在存儲(chǔ)上的SQLServer數(shù)據(jù)庫(kù),有1000多個(gè)文件,大小幾十TB。數(shù)據(jù)庫(kù)每10天生成一個(gè)NDF文件,每個(gè)NDF幾百GB大小。數(shù)據(jù)庫(kù)包含兩個(gè)LDF文件。 存儲(chǔ)損壞,數(shù)據(jù)庫(kù)
    的頭像 發(fā)表于 10-31 13:21 ?550次閱讀
    <b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b><b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>恢復(fù)—通過(guò)拼接<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b>碎片恢復(fù)SQLserver<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b>

    Oracle數(shù)據(jù)恢復(fù)—異常斷電后Oracle數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)報(bào)錯(cuò)的數(shù)據(jù)恢復(fù)案例

    Oracle數(shù)據(jù)庫(kù)故障: 機(jī)房異常斷電后,Oracle數(shù)據(jù)庫(kù)庫(kù)報(bào)錯(cuò):“system01.dbf需要更多的恢復(fù)來(lái)保持一致性,數(shù)據(jù)庫(kù)無(wú)法打開(kāi)”。數(shù)據(jù)
    的頭像 發(fā)表于 09-30 13:31 ?567次閱讀
    Oracle<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>恢復(fù)—異常斷電后Oracle<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b>啟<b class='flag-5'>庫(kù)</b>報(bào)錯(cuò)的<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>恢復(fù)案例

    數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)恢復(fù)—SQL Server數(shù)據(jù)庫(kù)出現(xiàn)823錯(cuò)誤的數(shù)據(jù)恢復(fù)案例

    SQL Server數(shù)據(jù)庫(kù)故障: SQL Server附加數(shù)據(jù)庫(kù)出現(xiàn)錯(cuò)誤823,附加數(shù)據(jù)庫(kù)失敗。數(shù)據(jù)庫(kù)沒(méi)有備份,無(wú)法通過(guò)備份恢復(fù)數(shù)據(jù)庫(kù)
    的頭像 發(fā)表于 09-20 11:46 ?563次閱讀
    <b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b><b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>恢復(fù)—SQL Server<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)庫(kù)</b>出現(xiàn)823錯(cuò)誤的<b class='flag-5'>數(shù)據(jù)</b>恢復(fù)案例

    JAVA應(yīng)用CPU跳點(diǎn)自動(dòng)DUMP工具

    問(wèn)題。如果CPU使用率過(guò)高,可能表示系統(tǒng)存在資源瓶頸,需要進(jìn)行優(yōu)化或升級(jí)。 CPU監(jiān)控的難點(diǎn) 現(xiàn)有的監(jiān)控平臺(tái)提供了多種方式來(lái)獲取容器和JVM的CPU
    的頭像 發(fā)表于 08-05 17:48 ?665次閱讀

    數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)恢復(fù)—SQL Server數(shù)據(jù)庫(kù)所在分區(qū)空間不足報(bào)錯(cuò)的數(shù)據(jù)恢復(fù)案例

    SQL Server數(shù)據(jù)庫(kù)數(shù)據(jù)恢復(fù)環(huán)境: 某品牌服務(wù)器存儲(chǔ)中有兩組raid5磁盤陣列。操作系統(tǒng)層面跑著SQL Server數(shù)據(jù)庫(kù),SQL Server數(shù)據(jù)庫(kù)存放在D盤分區(qū)中。
    的頭像 發(fā)表于 07-10 13:54 ?757次閱讀

    恒訊科技全面解析:如何有效降低服務(wù)器CPU用率

    降低服務(wù)器CPU用率是一個(gè)涉及監(jiān)控、診斷和優(yōu)化的全面過(guò)程。以下是一些有效的方法: 1、監(jiān)控CPU使用率: 使用工具如top, htop, vmstat, 或 iostat實(shí)時(shí)監(jiān)控
    的頭像 發(fā)表于 05-10 17:24 ?977次閱讀
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