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pandarallel模塊怎么用

科技綠洲 ? 來源:Python實用寶典 ? 作者:Python實用寶典 ? 2023-10-30 15:37 ? 次閱讀

眾所周知,由于GIL的存在,Python單進程中的所有操作都是在一個CPU核上進行的,所以為了提高運行速度,我們一般會采用多進程的方式。而多進程無非就是以下幾種方案:

  • multiprocessing
  • concurrent.futures.ProcessPoolExecutor()
  • joblib
  • ppserver
  • celery

這些方案對于普通Pandas玩家來說都不是特別友好,怎樣才能算作一個友好的并行處理方案?

那就是原來的邏輯我基本不用變,僅修改需要計算的那行就能完成我們目標的方案,而 pandarallel 就是一個這樣友好的工具。

沒有并行計算(原始pandas)

pandarallel

df.apply(func)

df.parallel_apply(func)

df.applymap(func)

df.parallel_applymap(func)

df.groupby(args).apply(func)

df.groupby(args).parallel_apply(func)

df.groupby(args1).col_name.rolling(args2).apply(func)

df.groupby(args1).col_name.rolling(args2).parallel_apply(func)

df.groupby(args1).col_name.expanding(args2).apply(func)

df.groupby(args1).col_name.expanding(args2).parallel_apply(func)

series.map(func)

series.parallel_map(func)

series.apply(func)

series.parallel_apply(func)

series.rolling(args).apply(func)

series.rolling(args).parallel_apply(func)

可以看到,在 pandarallel 的世界里,你只需要替換原有的 pandas 處理語句就能實現多CPU并行計算。非常方便、非常nice.

圖片

在4核CPU的性能測試上,它比原始語句快了接近4倍。測試條件(OS: Linux Ubuntu 16.04,Hardware: Intel Core i7 @ 3.40 GHz - 4 cores),這就是我所說的,它把CPU充分利用了起來。

下面就給大家介紹這個模塊怎么用,其實非常簡單,任何代碼只需要加幾行代碼就能實現質的飛躍。

1.準備

開始之前,你要確保Python和pip已經成功安裝在電腦上,如果沒有,可以訪問這篇文章:超詳細Python安裝指南 進行安裝。

**(可選1) **如果你用Python的目的是數據分析,可以直接安裝Anaconda:Python數據分析與挖掘好幫手—Anaconda,它內置了Python和pip.

**(可選2) **此外,推薦大家用VSCode編輯器,它有許多的優點:Python 編程的最好搭檔—VSCode 詳細指南。

請選擇以下任一種方式輸入命令安裝依賴

  1. Windows 環境 打開 Cmd (開始-運行-CMD)。
  2. MacOS 環境 打開 Terminal (command+空格輸入Terminal)。
  3. 如果你用的是 VSCode編輯器 或 Pycharm,可以直接使用界面下方的Terminal.
pip install pandarallel

對于windows用戶,有一個不好的消息是,它只能在Windows的linux子系統上運行(WSL),你可以在微軟官網上找到安裝教程

https://docs.microsoft.com/zh-cn/windows/wsl/about

2.使用Pandarallel

使用前,需要對Pandarallel進行初始化:

from pandarallel import pandarallel
pandarallel.initialize()

這樣才能調用并行計算的API,不過 initialize 中有一個重要參數需要說明,那就是 nb_workers ,它將指定并行計算的Worker數,如果沒有設置,所有CPU的核都會用上。

Pandarallel一共支持8種Pandas操作,下面是一個apply方法的例子。

import pandas as pd
import time
import math
import numpy as np
from pandarallel import pandarallel

# 初始化
pandarallel.initialize()
df_size = int(5e6)
df = pd.DataFrame(dict(a=np.random.randint(1, 8, df_size),
                       b=np.random.rand(df_size)))
def func(x):
    return math.sin(x.a**2) + math.sin(x.b**2)

# 正常處理
res = df.apply(func, axis=1)

# 并行處理
res_parallel = df.parallel_apply(func, axis=1)

# 查看結果是否相同
res.equals(res_parallel)

其他方法使用上也是類似的,在原始的函數名稱前加上 parallel_,比如 DataFrame.groupby.apply:

import pandas as pd
import time
import math
import numpy as np
from pandarallel import pandarallel

# 初始化
pandarallel.initialize()
df_size = int(3e7)
df = pd.DataFrame(dict(a=np.random.randint(1, 1000, df_size),
                       b=np.random.rand(df_size)))
def func(df):
    dum = 0
    for item in df.b:
        dum += math.log10(math.sqrt(math.exp(item**2)))
        
    return dum / len(df.b)

# 正常處理
res = df.groupby("a").apply(func)
# 并行處理
res_parallel = df.groupby("a").parallel_apply(func)
res.equals(res_parallel)

又比如 DataFrame.groupby.rolling.apply:

import pandas as pd
import time
import math
import numpy as np
from pandarallel import pandarallel

# 初始化
pandarallel.initialize()
df_size = int(1e6)
df = pd.DataFrame(dict(a=np.random.randint(1, 300, df_size),
                       b=np.random.rand(df_size)))
def func(x):
    return x.iloc[0] + x.iloc[1] ** 2 + x.iloc[2] ** 3 + x.iloc[3] ** 4

# 正常處理
res = df.groupby('a').b.rolling(4).apply(func, raw=False)
# 并行處理
res_parallel = df.groupby('a').b.rolling(4).parallel_apply(func, raw=False)
res.equals(res_parallel)

案例都是類似的,這里就直接列出表格,不浪費大家寶貴的時間去閱讀一些重復的例子了:

沒有并行計算(原始pandas)

pandarallel

df.apply(func)

df.parallel_apply(func)

df.applymap(func)

df.parallel_applymap(func)

df.groupby(args).apply(func)

df.groupby(args).parallel_apply(func)

df.groupby(args1).col_name.rolling(args2).apply(func)

df.groupby(args1).col_name.rolling(args2).parallel_apply(func)

df.groupby(args1).col_name.expanding(args2).apply(func)

df.groupby(args1).col_name.expanding(args2).parallel_apply(func)

series.map(func)

series.parallel_map(func)

series.apply(func)

series.parallel_apply(func)

series.rolling(args).apply(func)

series.rolling(args).parallel_apply(func)

3.注意事項

1. 我有 8 個 CPU,但 parallel_apply 只能加快大約4倍的計算速度。為什么?

答:正如我前面所言,Python中每個進程占用一個核,Pandarallel 最多只能加快到你所擁有的核心的總數,一個 4 核的超線程 CPU 將向操作系統顯示 8 個 CPU,但實際上只有 4 個核心,因此最多加快4倍。

2. 并行化是有成本的(實例化新進程,通過共享內存發送數據,...),所以只有當并行化的計算量足夠大時,并行化才是有意義的。對于很少量的數據,使用 Pandarallel 并不總是值得的。

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