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一支團隊成功對果蠅的完整大腦進行了成像,清晰度達到了納米級!

mK5P_AItists ? 來源:lq ? 2019-01-21 13:32 ? 次閱讀

摘要:在最新出版的《科學》雜志上,由麻省理工學院(MIT)和霍華德·休斯醫學研究所(HHMI)的科學家們領銜的一支團隊,成功對果蠅的完整大腦進行了成像,清晰度達到了納米級!

在最新出版的《科學》雜志上,由麻省理工學院(MIT)和霍華德·休斯醫學研究所(HHMI)的科學家們領銜的一支團隊,成功對果蠅的完整大腦進行了成像,清晰度達到了納米級!這讓我們能夠看清大腦中,不同的神經細胞,乃至蛋白質在空間上的相對分布,對基礎科研有著極為重要的意義。

這一重磅研究,也登上了本期《科學》的封面。

嬰兒尿布與大腦研究

本研究的通訊作者之一是MIT的知名科學家Edward S. Boyden教授。他最初因在光遺傳學上的研究而聞名于世,最近幾年則在大腦成像領域有著諸多突破性的貢獻。2015年,他獲得了有“科學界奧斯卡”之稱的“科學突破獎”(Breakthrough Prize)。2018年,他也獲得了有諾貝爾風向標稱號的蓋爾德納獎。

▲Edward S. Boyden教授是本研究的通訊作者之一(圖片來源:Edward S. Boyden教授課題組)

在2015年左右,Boyden教授團隊向解析大腦的高清結構發起了沖鋒,目標是理清大腦在細胞、乃至蛋白層面上如何進行組合。為了實現這一目標,科學家們開發了一種看起來很有趣的研究方法:他們首先往大腦組織樣本中注射一種膠狀物質,隨后讓這些凝膠吸水膨脹,把大腦撐開。

從原理上看,這和嬰兒尿布中的材料吸水膨脹,有著異曲同工之妙。

這種看起來簡單的方法,在解析大腦結構中扮演了重要的角色。在長、寬、高的維度上膨脹擴大2倍,整個體積就會擴大8倍。由于膨脹后的大腦組織更為松散,對其進行顯微觀察就成為了可能。更關鍵的是,大腦樣本中的這些神經細胞,相對位置被凝膠所固定,并不會發生變化。

▲果蠅大腦的擴大過程(圖片來源:參考資料[1])

正是因為這一突破,針對特定的大腦細胞或小型大腦區域,我們已經獲得了不少“高清地圖”。

兩種顯微技術的合力

在體積較小的大腦樣本中取得的成功,并不一定能被復制到大型腦組織里。這是因為樣本的體積越大,就越難對深埋其中的特定部分進行成像。如果單純為了“點亮”而增強光源,還會破壞用于做標記的熒光蛋白。可以說,這是一個兩難。

此外,大型腦組織在膨脹擴大之后,如何對整個結構進行快速的掃描成像,也就成了一個難題。“我們需要能夠快速成像,不會帶來太多光褪色(photobleaching)效應的顯微鏡”,本研究的共同第一作者Ruixuan Gao博士說道。而他們知道,HHMI的Eric Betzig教授課題組中,就有這么一臺高級的顯微鏡。

▲本研究的共同第一作者Ruixuan Gao博士(圖片來源:Edward S. Boyden教授課題組)

Betzig教授的顯微鏡叫做“晶格層光顯微鏡”(lattice light-sheet microscope)。它每次只會照亮超級薄的一層樣本,將對樣本的損害降到了最低。此外,它也能快速對樣本進行成像,這正是研究人員們所需要的技術。

順便一提,由于在顯微成像技術上的突破,Betzig教授曾獲得2014年的諾貝爾化學獎。

▲Betzig教授是2014年諾貝爾化學獎得主之一(圖片來源:諾貝爾獎官方網站)

這名諾獎得主起初并不相信他的顯微鏡能提供多少幫助,但他依然大度地邀請研究人員們前去嘗試。

Ruixuan Gao博士與另一名共同一作Shoh Asano博士帶去了一些經過膨脹擴大的小鼠大腦組織,在晶格層光顯微鏡下進行觀察。通過結合“擴大顯微技術”和“晶格層光顯微技術”,他們看到了神經元上的許多樹突棘結構。這種微小的結構看起來就像是蘑菇,有著龐大的頭部,以及細長的根部。過去,樹突棘的成像一直是一個挑戰。然而在兩種顯微技術的合力下,研究人員們連“最細小的根部”都可以看到。

▲研究人員們看到了樹突棘的“森林”(圖片來源:參考資料[1])

“我簡直不敢相信數據的質量,” Betzig教授說道:“用一根羽毛,你就可以把(震驚的)我推倒?!?/p>

暢游果蠅的大腦

在驚人的圖像質量面前,兩支科研團隊迅速達成合作。在兩年多的時間里,Ruixuan Gao博士與Shoh Asano博士,以及其他生物學家,顯微鏡專家,以及計算機專家一道,拍攝了大量的圖片,并對其進行分析。

“我們就像是復仇者聯盟?!?Ruixuan Gao博士這樣評論他們的合作關系。

▲看清大腦結構,一直是科研人員們的夢想(圖片來源:參考資料[1])

這些研究帶來的最大亮點之一,就是對完整果蠅大腦的成像分析。從每個果蠅大腦中,科學家們都獲得了大約50000個立體圖像。隨后,計算機就像是做三維拼圖一般,把這些立體圖像拼成一個完整的果蠅大腦。

研究人員們說,他們研究了超過1500個樹突棘,觀察了保護神經細胞的髓鞘,標出了所有的多巴胺能神經元,并數清了整個果蠅大腦中存在的突觸。

這些圖像的清晰度高達60納米,成像過程不超過3天。隨著效率不斷提高,將來,我們有望在一天之內就對10個果蠅大腦進行立體成像。

“我們能用極快的速度,對非常大體積的樣本進行分析,獲得高清的圖像?!盉oyden教授說道。

這一研究為神經科學帶來了極為重要的研究工具。它讓我們可以理解不同的神經環路如何組成,性別對大腦有怎樣的影響,疾病又會怎樣破壞大腦。

對研究神經科學的生物學家來說,這可能是最好的時代。

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原文標題:今日《科學》封面:納米級清晰度看大腦是怎樣一種體驗?

文章出處:【微信號:AItists,微信公眾號:人工智能學家】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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