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目前，大型設計一般推薦使用同步時序電路。同步時序電路基于時鐘觸發沿設計，對時鐘的周期、占空比、延時和抖動提出了更高的要求。為了滿足同步時序設計的要求，一般在FPGA設計中采用全局時鐘資源驅動設計的主時鐘，以達到最低的時鐘抖動和延遲。 FPGA全局時鐘資源一般使用全銅層工藝實現，并設計了專用時鐘緩沖與驅動結構，從而使全局時鐘到達芯片內部的所有可配置單元（CLB）、I/O單元（IOB）和選擇性塊RAM（Block Select RAM）的時延和抖動都為最小。為了適應復雜設計的需要，Xilinx的FPGA中集成的專用時鐘資源與數字延遲鎖相環（DLL）的數目不斷增加，最新的Virtex II器件最多可以提供16個全局時鐘輸入端口和8個數字時鐘管理模塊（DCM）。
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