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IoT PCR:連接到互聯(lián)網(wǎng)的低成本DNA復(fù)制

2023-07-05 | zip | 0.10 MB | 次下載 | 免費(fèi)

資料介紹

描述

什么是 PCR 熱循環(huán)儀?

PCR 熱循環(huán)儀是一種能夠以可控方式在所需溫度之間變化以正確進(jìn)行聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng) (PCR) 的設(shè)備。?

什么是 PCR?

聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)是一種用于復(fù)制 DNA 某些部分的反應(yīng)。復(fù)制 DNA 的過(guò)程包括許多步驟。這是一個(gè)簡(jiǎn)化版本:

步驟 1.) DNA 被加熱到 95 C 以使 DNA 變性。加熱時(shí),堿基對(duì)之間的氫鍵開(kāi)始斷裂,分離 DNA 中的螺旋,從而產(chǎn)生 2 條互補(bǔ)的 DNA 鏈。

步驟 2.) 然后將樣品降低到 55°C 20-40 秒,以使引物(作為聚合酶起始點(diǎn)的小 DNA 鏈)與 DNA 結(jié)合。

步驟 3.) 然后將樣品升高到所用聚合酶(通常是 Taq 聚合酶)的最佳溫度,然后使聚合酶與引物結(jié)合并通過(guò)添加核苷酸開(kāi)始完成 DNA 鏈。

步驟 4.) 重復(fù)過(guò)程

如果您有足夠的聚合酶、引物和核苷酸,這可以無(wú)限期地繼續(xù)下去。每重復(fù)一次循環(huán),DNA 的數(shù)量就會(huì)增加一倍。

我將做什么與商業(yè) PCR 熱循環(huán)儀不同?

實(shí)驗(yàn)室級(jí)和商業(yè) PCR 熱循環(huán)儀花費(fèi)數(shù)萬(wàn)美元,旨在容納數(shù)百個(gè)樣本。它們很難使用,您需要對(duì)所使用的聚合酶有廣泛的了解才能成功進(jìn)行反應(yīng)。我的目標(biāo)是開(kāi)發(fā)一款低成本、易于使用的熱循環(huán)儀,可供對(duì)該主題知之甚少的高中生使用。這對(duì)個(gè)人使用和教育都有好處。不僅如此,由于我們可以通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)控制它,我將開(kāi)發(fā)一個(gè)控制熱循環(huán)儀的應(yīng)用程序,并為用戶開(kāi)發(fā)一套預(yù)設(shè),讓他或她更容易操作設(shè)備。

PCR有什么用?

一旦擴(kuò)增,PCR 產(chǎn)生的 DNA 可用于許多不同的實(shí)驗(yàn)室程序。例如,人類(lèi)基因組計(jì)劃 (HGP) 中的大多數(shù)作圖技術(shù)都依賴于 PCR。PCR 在許多實(shí)驗(yàn)室和臨床技術(shù)中也很有價(jià)值,包括 DNA 指紋識(shí)別、細(xì)菌或病毒檢測(cè)(特別是 AIDS)以及遺傳疾病的診斷。長(zhǎng)話短說(shuō),PCR 幾乎可用于涉及 DNA/RNA 的任何事情。

我的構(gòu)建

我使用了一個(gè)連接到繼電器和加熱/冷卻設(shè)備的 Arduino MKR1000。?

?
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poYBAGOYo9iAdgWsAAcWLuPE8Lw234.jpg
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1 / 2 ? MKR1000 + 面包板上的 PCR 電路
?

電路/原理圖

pYYBAGOYo9uAXMZUAAFnCFCbDoQ674.png
Fritzing 原理圖與 Arduino UNO(與 MKR1000 一起使用)
?

注意:將數(shù)字輸出線從 DIGITAL 12 更改為 DIGITAL 6。

?

我計(jì)劃稍后添加的內(nèi)容

我可能還會(huì)添加 LCD 顯示器、清理 UI、添加 LED 指示燈、手動(dòng)控制、修復(fù)應(yīng)用程序的一些問(wèn)題,并為 Arduino 制作屏蔽或 PCB


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