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人類(lèi)互作網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淠K分析

2017-12-13 | rar | 0.98 MB | 次下載 | 免費(fèi)

資料介紹

  鑒于網(wǎng)絡(luò)醫(yī)學(xué)中尚未有對(duì)疾病分類(lèi)與功能蛋白模塊功能同質(zhì)性分析之間關(guān)系的研究,展開(kāi)以下研究工作:首先,利用Mesh、String9等數(shù)據(jù)庫(kù)中的數(shù)據(jù)構(gòu)建了基因關(guān)系網(wǎng)絡(luò);其次,采用基于優(yōu)化模塊度的模塊劃分方法(如BCLL、非負(fù)矩陣分解(NMF)等聚類(lèi)算法)對(duì)基因關(guān)系網(wǎng)絡(luò)進(jìn)行了劃分;再次,對(duì)劃分出來(lái)的模塊進(jìn)行了GO富集分析,通過(guò)對(duì)高致病拓?fù)淠K和低致病拓?fù)淠K的CO富集分析的比較,發(fā)現(xiàn)了疾病分類(lèi)和蛋白模塊功能特性在生物過(guò)程、細(xì)胞組分、分子功能等方面存在重要的生物學(xué)提示;最后,分析了疾病分類(lèi)的拓?fù)淠K的功能特性,通過(guò)對(duì)網(wǎng)絡(luò)拓?fù)湫再|(zhì)如平均度、密度、平均最短路徑長(zhǎng)度等方面的分析得到了各模塊的功能特點(diǎn)數(shù)據(jù),進(jìn)一步揭示了疾病分類(lèi)和功能模塊之間的相關(guān)關(guān)系。

人類(lèi)互作網(wǎng)絡(luò)拓?fù)淠K分析

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