為了檢測引起新冠病毒肺炎(COVID-19)的SARS-CoV-2病毒,Oxford Nanopore Technologies公司正在著手開發一種快速且低成本的檢測。目前,這種名為LamPORE的檢測已進入開發的后期階段。
LamPORE檢測是基于Oxford Nanopore的DNA/RNA測序技術,而樣本制備則采用了環介導等溫擴增(LAMP)技術以及Oxford Nanopore的快速建庫試劑盒。它能夠檢測樣本中是否含有SARS-CoV-2病毒。
自從SARS-CoV-2病毒出現以來,Oxford Nanopore的快速便攜式測序技術已大量用于COVID-19的流行病學和科學研究。LamPORE是該公司內部開發的首個檢測產品,可在GridION或MinION測序設備上運行。
LAMP技術本身已被用于病毒的檢測,可根據顏色來判斷結果,但在大規模運行時基于顏色的結果判斷頗具挑戰性。LamPORE將成熟的LAMP方法與Oxford Nanopore測序技術相結合,可獲得精確的數字結果。同時,這項檢測不依賴于現有的檢測硬件和試劑。眾所周知,目前全球都面臨RT-qPCR設備和試劑的短缺。
LamPORE檢測不僅快速,還具有可擴展性,可同時運行多個樣本。利用便攜式的MinION測序設備,大約1小時可分析96個樣本,在4.5小時內可分析1,152個樣本。若利用臺式的GridION測序設備,在同樣的時間內能夠處理五倍數量的樣本。該檢測適用于鼻咽拭子或唾液樣本。
據介紹,LamPORE方法還有進一步開發的潛力,有望同時檢測包括SARS-CoV-2病毒在內的多種病原體。隨著時間的推移,當COVID-19的患病率下降,而其他呼吸道病原體的患病率上升時,這有望發揮作用。
LamPORE檢測可以在實驗室內集中開展,應用于一線員工的例行檢查或復工后的大規模檢查。同時,它也可以部署在本地化環境中,比如養老院、交通樞紐、企業或其他社區環境。快速的周轉流程對于迅速隔離疑似患者和防止病毒繼續傳播特別重要。
Oxford Nanopore首席執行官Gordon Sanghera博士表示:“我們設計的首款納米孔測序儀可被任何科學家在任何地方使用。現在,借助LamPORE,我們希望將納米孔測序的普適性和可擴展性引入快速分析領域。”
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原文標題:Oxford Nanopore開發出快速且低成本的新冠檢測產品
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