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基于微流控的電泳核酸濃縮技術(shù)

微流控 ? 來源:麥姆斯咨詢 ? 作者:麥姆斯咨詢 ? 2022-10-20 09:45 ? 次閱讀

熒光檢測(cè)是當(dāng)下最靈敏的光譜檢測(cè)技術(shù)之一,通過對(duì)光源調(diào)頻可以選擇激發(fā)躍遷的初始狀態(tài)和終了狀態(tài),因此可以解析分子的十分復(fù)雜的譜帶,與其他光譜法相比,其具有靈敏度高、適用性好等優(yōu)點(diǎn)。然而,光學(xué)元件的小型化和光學(xué)配置是小型化熒光檢測(cè)器發(fā)展的兩大挑戰(zhàn)。

據(jù)麥姆斯咨詢報(bào)道,近期,來自上海應(yīng)用技術(shù)大學(xué)的研究人員于《微納電子技術(shù)》期刊發(fā)表論文,設(shè)計(jì)并制備了搭載熒光修飾核酸探OMUpy2-probe的微芯片的兩種優(yōu)化結(jié)構(gòu)。第一種結(jié)構(gòu)應(yīng)用薄膜的光干涉效應(yīng),通過濕法腐蝕法制備石英薄膜,腐蝕過程中采用Cr作為保護(hù)膜形成石英玻璃、石英薄膜和石英玻璃的三層結(jié)構(gòu),減少了原聚二甲基硅氧烷(PDMS)層在波長(zhǎng)400-500nm的背景熒光;第二種結(jié)構(gòu)利用核酸的內(nèi)容位點(diǎn)帶負(fù)電,通過電泳的方式對(duì)核酸進(jìn)行濃縮,并將Au電極連接到200μm寬的流路的兩側(cè),設(shè)置電極電壓為0.1V,進(jìn)行電泳濃縮實(shí)驗(yàn)。總之,該研究提出的兩種優(yōu)化結(jié)構(gòu)彌補(bǔ)了原芯片在光學(xué)實(shí)驗(yàn)中和低濃度實(shí)驗(yàn)條件下的缺陷。

PDMS層的改進(jìn)

原芯片分為兩部分,分別為具有高透光率和易于加工的PDMS層組成的上部和具有優(yōu)異紫外光透射率的石英玻璃層組成的下部。PDMS材料可通過簡(jiǎn)單的方法用于構(gòu)建各種模式的通道。然而,從迄今為止報(bào)道的實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),在絕大多數(shù)PDMS芯片中,PDMS層會(huì)顯示自發(fā)的高熒光,由于激發(fā)光的反射,熒光光譜的背景干擾會(huì)增強(qiáng)。

而石英具有獨(dú)特的光學(xué)特性,且石英玻璃耐高溫、熱膨脹系數(shù)極小、化學(xué)熱穩(wěn)定性好,因此,在該研究中,研究人員采用石英替代了原芯片使用的PDMS。但更替為石英無法完全抑制散射光反射,相反,石英玻璃可能因材質(zhì)會(huì)使光學(xué)均勻性不穩(wěn)定,并導(dǎo)致其熒光更加分散,從而使散射光再次激發(fā),所以研究人員在制備過程中應(yīng)用了薄膜的光干涉效應(yīng)。具體來看,研究人員在由石英玻璃構(gòu)成的流路層上添加一層由石英玻璃構(gòu)成的薄膜,然后和下部的石英玻璃鍵合,構(gòu)成石英玻璃、石英薄膜與石英玻璃的三層結(jié)構(gòu),如圖1所示。薄膜制備和芯片制備流程圖如圖2所示。

78488180-5017-11ed-a3b6-dac502259ad0.png 圖1 石英芯片三層結(jié)構(gòu)示意圖 ?

7858daee-5017-11ed-a3b6-dac502259ad0.png

圖2 薄膜制備和石英芯片制備流程圖

電泳濃縮核酸

在考慮了熒光檢測(cè)芯片原材料的優(yōu)化后,研究人員設(shè)計(jì)了一種電化學(xué)濃縮核酸的方法,以便在低濃度區(qū)域進(jìn)行檢測(cè)。此外,研究人員采用了兩種電極使用方法:一種是電極從流路兩端接入;另一種是電極從流路側(cè)方接入。為了確認(rèn)芯片能否進(jìn)行核酸濃縮,使用制備的石英芯片,采用第一種電極接入方法,在微溝道中插入鉑絲(Pt)作為體電極來確認(rèn)熒光標(biāo)記的RNA(濃度為1μmol/L)的電泳。體電極核酸濃縮示意圖如圖3所示。

788d173c-5017-11ed-a3b6-dac502259ad0.png圖3 體電極核酸濃縮示意圖

而第二種方法采用剝離工藝,以Cr/Al作為電極材料,制作了Cr/Al薄膜電極。電極從流路側(cè)方接入,Cr/Al薄膜電極的制備流程圖如圖4所示。因在后續(xù)實(shí)驗(yàn)過程中出現(xiàn)了電極脫落的現(xiàn)象,研究人員將電極材料由Cr/Al改為Au,制備流程與圖4流程基本一致,實(shí)驗(yàn)示意圖如圖5所示,將Au電極與微溝道相連接(圖5(a)),然后用Cu作為導(dǎo)電材料連接Au電極,使用折射率為1.516的顯微鏡浸油和倍數(shù)100的物鏡進(jìn)行觀察(圖5(b))。

7898f6d8-5017-11ed-a3b6-dac502259ad0.png 圖4 薄膜電極制備流程圖 ?78bafb66-5017-11ed-a3b6-dac502259ad0.png 圖5 RNA電泳示意圖 ?

進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn),當(dāng)電極材質(zhì)為Au、電極電壓在0.82V以下時(shí),才能使電極不發(fā)生脫落,樣品溶液不發(fā)生電解。當(dāng)電極電壓為0.1V、電泳時(shí)間達(dá)到80s時(shí),核酸濃度比和熒光強(qiáng)度為最大值,核酸濃度比提高了約6.07倍,熒光強(qiáng)度提高了約2.28倍。綜上所述,所制備的微芯片既能改善熒光背景誤差,又能在低濃度樣品下濃縮核酸,提高熒光強(qiáng)度。

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圖6 樣品濃度為1μmol/L、電極電壓為0.1V時(shí)不同電泳時(shí)間的熒光效果圖

論文鏈接: http://dx.doi.org/10.13250/j.cnki.wndz.2022.10.014 審核編輯 :李倩

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原文標(biāo)題:基于微流控的電泳核酸濃縮技術(shù),提升低濃度核酸樣本熒光檢測(cè)性能

文章出處:【微信號(hào):Micro-Fluidics,微信公眾號(hào):微流控】歡迎添加關(guān)注!文章轉(zhuǎn)載請(qǐng)注明出處。

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