sCMOS相機(jī)從2010年左右開始大規(guī)模商業(yè)化,并迅速地替代CCD相機(jī)成為高端科研相機(jī)的主流。諸如濱松ORCA-Flash 4.0等一批旗艦sCMOS以其高速高靈敏度的特征,也逐漸被用于超分辨顯微成像、lightsheet等尖端成像應(yīng)用中。
無論對于CCD相機(jī)還是sCMOS相機(jī),讀出速度越快,讀出噪聲越高。而sCMOS相對于CCD的一個(gè)核心優(yōu)勢,就是高速讀出時(shí)依然能夠保持極低的讀出噪聲。
以最為經(jīng)典的旗艦級sCMOS(濱松ORCA-Flash 4.0)和當(dāng)年頂級的冷CCD相機(jī)(濱松ORCA-R2)為例:sCMOS相機(jī)(100幀/秒 @ 420萬像素)不僅速度上遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出CCD 相機(jī)(16.2幀/秒 @ 130萬像素),其讀出噪聲也大大低于CCD相機(jī)(如圖1)。
圖1. sCMOS與CCD的讀出噪聲參數(shù)示例
但仔細(xì)看上圖的參數(shù)表,我們不難發(fā)現(xiàn)一個(gè)有趣的問題——為什么CCD相機(jī)的讀出噪聲就一個(gè)數(shù)值,而sCMOS相機(jī)的讀出噪聲分別標(biāo)注了rms和median兩個(gè)數(shù)值?而且median的數(shù)值都會較低?
為了回答這個(gè)問題,我們首先得明白相機(jī)讀出數(shù)據(jù)的基本流程。
相機(jī)讀出的基本流程
無論是CCD還是sCMOS,其基本的原理是一致的:(1)入射的光子在各個(gè)像素中轉(zhuǎn)化為電子;(2)這些電子接著通過floating diffusion amplifier(FDA)轉(zhuǎn)化為電壓;(3)電壓會被再次放大,并通過模數(shù)轉(zhuǎn)換器(ADC)變成數(shù)字信號。落到各個(gè)像素上的光子被如此轉(zhuǎn)化為數(shù)字信號,并最終在電腦上排列顯示成圖像。
圖2. 相機(jī)讀出的基本流程示意
sCMOS與CCD在讀出結(jié)構(gòu)上的區(qū)別
對于CCD,每個(gè)像素的電子會逐一通過同一套包含F(xiàn)DA、ADC的電路進(jìn)行讀出;而在sCMOS中,每個(gè)像素都有自己的FDA電路,而每行像素也都有各自包含ADC的電路。
圖3. CCD(A)與sCMOS(B)在相機(jī)讀出結(jié)構(gòu)上的區(qū)別
sCMOS和CCD中讀出噪聲的評價(jià)參數(shù)
在整個(gè)信號讀出過程中都會引入噪聲——稱之為讀出噪聲。如 《信噪比——高端科研級相機(jī)的核心參數(shù)》 一文中所述,相機(jī)的噪聲主要來源于三個(gè)部分——信號的散粒噪聲、暗電流的散粒噪聲和讀出噪聲。為了從圖像中測量計(jì)算讀出噪聲,就需要將前兩者的影響消除或降到最低,僅保留由于電路讀出過程所產(chǎn)生的讀出噪聲。所以測量讀出噪聲時(shí)用的都是將相機(jī)的蓋子蓋上(沒有信號)并采用最短的曝光時(shí)間(最大限度減少暗電流的累積)所得到的圖片(稱為dark image)。通過約1000張這樣的圖片,每個(gè)像素都能得到約1000個(gè)讀出數(shù)值——其標(biāo)準(zhǔn)差(standard deviation,σ)可以反映出對應(yīng)像素的讀出噪聲大小。
圖4. sCMOS與CCD的讀出噪聲參數(shù)。讀出噪聲一般以電子為單位,與相機(jī)芯片上光子轉(zhuǎn)化成的電子保持一致以便比較。
在CCD中,由于讀出電路對于所有像素是一樣的,所以每個(gè)像素所得出的標(biāo)準(zhǔn)差(σ)也基本一致,故而CCD相機(jī)的參數(shù)表中,一個(gè)單獨(dú)的數(shù)值——各個(gè)像素的σ的均方根(RMS)——就能夠代表其讀出噪聲。
而sCMOS各個(gè)像素所對應(yīng)的讀出電路則并不相同,會形成一個(gè)分布曲線(如圖5)。為了展現(xiàn)這條曲線的特征,sCMOS相機(jī)的參數(shù)表中一般會給出Median和RMS兩個(gè)數(shù)值——前者是所有像素的σ的中位數(shù);后者是所有像素的σ的均方根(RMS)(如圖4)。
圖5. sCMOS相機(jī)的讀出噪聲分布曲線示例
由于sCMOS相機(jī)芯片上總會有很少量但讀出噪聲特別高的像素(稱為noisy pixel,如圖6)——對中位數(shù)影響要小于對RMS的影響,所以一般情況下Median數(shù)值會低于RMS數(shù)值。
sCMOS中noisy pixel的處理
當(dāng)信號比較強(qiáng)的時(shí)候,來自信號的散粒噪聲是主導(dǎo),上述的noisy pixel并不重要(詳細(xì)參考 《信噪比——高端科研級相機(jī)的核心參數(shù)》 )。但當(dāng)弱光成像時(shí),這些像素會影響到三維重組、x-z/y-z image projection等許多圖像后處理;尤其在STORM等超分辨顯微技術(shù)中,這些噪聲特別高像素也是需要注意的問題(Huang F., et al., Nature Methods, DOI:10.1038/NMETH.2488(2013))。所以如何消除這些noisy pixel的影響是當(dāng)前sCMOS相機(jī)發(fā)展中的一個(gè)重要問題。
濱松一直關(guān)注高端成像的需求,對這個(gè)問題提供了兩個(gè)層次的解決方案:
(1)在電路等相機(jī)硬件設(shè)計(jì)中,不僅追求更低的讀出噪聲參數(shù),尤其關(guān)注減少noisy pixel。圖6-B,D為ORCA-Fusion相機(jī)的實(shí)際圖片,相比于前代的ORCA-Flash 4.0(圖6-A,C),其noisy pixel明顯減少。
圖6. ORCA-Flash 4.0(A,C)與ORCA-Fusion(B,D)的dark image對比。ORCA-Fusion的noisy pixel明顯較少。所有圖片都設(shè)置了相同的Look-up table,以便比較。
(2)提供4檔可調(diào)的像素校正功能。在最強(qiáng)的校正中,即使長時(shí)間曝光的圖像也不會出現(xiàn)明顯的噪點(diǎn);而反過來,也可以選擇完全不進(jìn)行任何校正得到最為原始的數(shù)據(jù),利于需要自行設(shè)計(jì)算法的成像技術(shù)開發(fā)。
審核編輯黃宇
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