AI 驅(qū)動(dòng)的醫(yī)學(xué)有望為世界上最易受影響的人群帶來(lái)救及時(shí)的蛇咬傷治療。
每年,被毒蛇咬傷并導(dǎo)致死亡的人數(shù)超過(guò) 10 萬(wàn),另外約有 30 萬(wàn)人因此受到嚴(yán)重傷殘,包括截肢、癱瘓和永久性殘疾。受害者大多是撒哈拉以南非洲、南亞和拉丁美洲農(nóng)村地區(qū)的農(nóng)民、牧民和兒童。對(duì)他們來(lái)說(shuō),被蛇咬傷不僅是一場(chǎng)醫(yī)療危機(jī),更是一場(chǎng)經(jīng)濟(jì)災(zāi)難。
一個(gè)多世紀(jì)以來(lái),并沒(méi)有很好的針對(duì)毒蛇咬傷的療法。抗蛇毒血清取自免疫動(dòng)物的血液,價(jià)格昂貴,生產(chǎn)難度大,而且對(duì)于最致命的毒素往往效果不佳。更具挑戰(zhàn)的是,抗蛇毒血清需要冷藏保存,還需要專業(yè)的醫(yī)護(hù)人員進(jìn)行注射,這使得很多有急迫需求的人得不到及時(shí)的治療。
如今,由計(jì)算生物學(xué)家 Susana Vázquez Torres 領(lǐng)導(dǎo)的團(tuán)隊(duì),利用 AI 技術(shù)創(chuàng)造出了全新的蛋白質(zhì)。在實(shí)驗(yàn)室測(cè)試中,這些蛋白質(zhì)能夠中和致命的蛇毒,而且比傳統(tǒng)抗蛇毒血清速度更快、成本更低、效果更好。Susana Vázquez Torres 就職于著名的由諾貝爾獎(jiǎng)得主 David Baker 領(lǐng)導(dǎo)的華盛頓大學(xué)蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)研究所。團(tuán)隊(duì)發(fā)表在《自然》雜志上的研究成果,介紹了一類新型合成蛋白質(zhì),這類蛋白質(zhì)能夠成功保護(hù)動(dòng)物免受很有可能致命劑量的蛇毒毒素的侵害。
AI 如何破解蛇毒密碼
一個(gè)多世紀(jì)以來(lái),抗蛇毒血清的生產(chǎn)一直依賴動(dòng)物免疫,這需要從數(shù)千條蛇身上采集毒液并提取血漿。Torres 和她的團(tuán)隊(duì)希望用 AI 驅(qū)動(dòng)的蛋白質(zhì)設(shè)計(jì)來(lái)取代這種方法,將需要?dú)v時(shí)數(shù)年的工作壓縮到幾周內(nèi)完成。
該團(tuán)隊(duì)利用NVIDIA Ampere架構(gòu)和 GPU,通過(guò)包括 RFdiffusion 和 ProteinMPNN 在內(nèi)的深度學(xué)習(xí)模型,通過(guò)計(jì)算機(jī)仿真生成了數(shù)百萬(wàn)種潛在的抗毒素結(jié)構(gòu)。不同于傳統(tǒng)的形式,需要在實(shí)驗(yàn)室中篩選大量此類蛋白質(zhì),該團(tuán)隊(duì)借助 AI 工具預(yù)測(cè)這些設(shè)計(jì)出的蛋白質(zhì)將如何與蛇毒毒素相互作用,從而迅速制定出最有前景的設(shè)計(jì)。
取得的成果也令人矚目:
新設(shè)計(jì)的蛋白質(zhì)與三指毒素(3FTx)緊密結(jié)合,三指毒素是眼鏡蛇科蛇毒中最致命的成分,新設(shè)計(jì)的蛋白質(zhì)有效地中和了其毒性;
實(shí)驗(yàn)室的測(cè)試證實(shí)了這些蛋白質(zhì)具有高度穩(wěn)定性和中和能力;
通過(guò)小白鼠實(shí)驗(yàn),在接觸致命神經(jīng)毒素后,小鼠的存活率達(dá)到 80% - 100%。
AI 設(shè)計(jì)的蛋白質(zhì)體積小、耐熱且易于生產(chǎn)、無(wú)需冷藏。
為最易被忽視的受害者帶來(lái)生機(jī)
與每劑數(shù)百美元的傳統(tǒng)抗蛇毒血清不同,這些由 AI 設(shè)計(jì)的蛋白質(zhì)有可能實(shí)現(xiàn)低成本大規(guī)模生產(chǎn),從而讓有迫切需求的患者能夠獲得及時(shí)的治療。
許多蛇咬傷受害者因無(wú)力承擔(dān)抗蛇毒血清的費(fèi)用,或因費(fèi)用和可及性障礙而延誤治療。在某些情況下,治療的經(jīng)濟(jì)負(fù)擔(dān)會(huì)使整個(gè)家庭陷入更深的貧困。有了這種易于獲取、價(jià)格親民且常溫下可長(zhǎng)期保存的解毒劑,數(shù)百萬(wàn)的生命和家庭有望得到幫助。
遠(yuǎn)不止蛇咬傷治療:
AI 設(shè)計(jì)藥物的未來(lái)
研究人員表示,這項(xiàng)研究的意義不止于蛇咬傷治療。由 AI 驅(qū)動(dòng)方法可用于設(shè)計(jì)針對(duì)病毒感染、自身免疫性疾病和其他難治性疾病的精準(zhǔn)治療方案。
研究人員利用 AI 設(shè)計(jì)蛋白質(zhì),可以通過(guò)精準(zhǔn)的算法取代試錯(cuò)式的藥物研發(fā)方式,致力于在全球范圍內(nèi)降低救命藥物的成本,使其更加經(jīng)濟(jì)且易于獲取。
Torres 和她的合作伙伴,包括來(lái)自丹麥技術(shù)大學(xué)、北科羅拉多大學(xué)和利物浦熱帶醫(yī)學(xué)院的研究人員,目前正專注于將這些中和蛇毒的蛋白質(zhì)用于臨床試驗(yàn)和大規(guī)模生產(chǎn)。如果取得成功,這項(xiàng)由 AI 推動(dòng)的革新將拯救無(wú)數(shù)生命,為世界各地的家庭和社區(qū)創(chuàng)造福祉。
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原文標(biāo)題:AI 設(shè)計(jì)的蛋白質(zhì)對(duì)抗致命蛇毒
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