美國阿貢國家實驗室、Flagship Pioneering、Terray、Weights & Biases 和其他數十家組織機構正在推動生物分子科學的發展

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SC24 – NVIDIA 今日宣布，全球制藥和科技生物行業的領導者、學術先鋒和 AI 研究人員正在使用開源的 NVIDIA? BioNeMo? 框架，來推進藥物研發并加速分子設計。

研究人員需要專門的生物分子模型和數據集來大規模地收集洞察，以便更快地設計治療方案。開源 BioNeMo 框架提供了一系列加速計算工具，旨在為生物分子研究提供指數級擴展的 AI 模型，為生物制藥領域帶來新的超級算力水平。
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NVIDIA 醫療健康與生命科學總經理兼副總裁 Kimberly Powell 表示：“最近的諾貝爾化學獎證明了 AI、加速計算和日益擴大的數據集的融合為制藥行業創造了前所未有的機遇。為了幫助解開生物系統的復雜奧秘，我們推出了 BioNeMo 開源框架，它將使全球各地的研究人員能夠更快開發出挽救生命的治療方法。”
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領先的生物技術公司、科技生物研究人員以及 AI 平臺公司與組織已經或即將為這一開源框架做出貢獻，包括 A Alpha Bio、美國阿貢國家實驗室、Dyno Therapeutics、羅氏集團的成員基因泰克、Ginkgo Bioworks、Relation、VantAI 和 Weights & Biases。另外，以推動計算科學發展著稱的領先重點科研機構也使用 BioNeMo 框架推動創新。
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美國阿貢國家實驗室計算科學小組負責人 Arvind Ramanathan 表示：“美國阿貢國家實驗室貢獻了數十億參數的生物模型，這些模型需要使用專門的軟件在高性能計算環境中訓練而成。BioNeMo 為美國阿貢國家實驗室和更廣泛的生物技術社群提供了一個企業級開源解決方案，使研究人員能夠在本來不具備足夠的計算專業知識的實驗室中，輕松擴展大型生物基礎模型的訓練規模。”
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推出下一代 BioNeMo 平臺
這個端到端 NVIDIA BioNeMo 平臺專為加快 AI 藥物研發和分子設計模型的創建、定制與部署而設計。通過與加速計算基礎設施無縫集成，該平臺能夠降低成本、擴大規模，并加快藥物研發流程的速度，進而從生物分子數據中提煉出快速、可靠的洞察。

除 BioNeMo 框架外，該平臺還支持 NVIDIA NIM?（經過優化的安全、可擴展 AI 推理微服務）和 NVIDIA BioNeMo Blueprints，后者是針對濕實驗室和計算工作流的優化參考設計。
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NVIDIA 還發布了適用于 BioNeMo 的一系列經過優化且易于使用的全新 NIM 微服務。這些微服務可以快速、輕松地部署在本地或任何數據中心或云中，使開發人員能夠在各種不同的環境中靈活運行應用，并縮短了生物藥物研發研究中從推理到獲得洞察的時間。
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新推出的 NIM 微服務支持業界領先的模型，包括：
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AlphaFold2 是谷歌 DeepMind 開發的深度學習模型，該模型專為改變蛋白質結構預測而設計。通過使用適用于 BioNeMo 的 AlphaFold2 NIM 微服務，研究人員近乎實時地預測蛋白質結構的速度提高了 5 倍。

DiffDock 2.0 基于麻省理工學院的研究成果，并在金標準 PLINDER 數據集上訓練而成。借助 DiffDock 2.0 NIM 微服務，研究人員預測分子取向的速度提高了 6.2 倍，準確率提高了 16%。

RFdiffusion 和 ProteinMPNN NIM 微服務幫助研究人員更快設計出與目標分子結合的新型蛋白質，并推動新的蛋白質療法的創造。

BioNeMo 現在加入了包括 cuEquivariance 在內的全新加速庫，能夠加速 DiffDock 化學預測所必需的數學計算。
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企業可以使用 NVIDIA BioNeMo Blueprints（一個可定制的參考 AI 工作流目錄）來幫助開發人員將其 AI 部署擴展為企業級生產管線。
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用于虛擬篩選的 BioNeMo Blueprint 提供了一個可定制且易于遵循的工作流，不但能夠使用 NIM 微服務來更快設計出小分子，同時還能節省時間和成本。
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目前已有 200 多家科技生物公司、大型制藥公司和初創企業用戶將 BioNeMo 集成到其計算機輔助藥物研發平臺和工作流中。
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埃森哲、亞馬遜云科技（AWS）和德勤等全球系統集成商、軟件提供商和云服務提供商正在將 NVIDIA BioNeMo Blueprints 帶給全球各地的企業。
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