基于遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的深度學(xué)習(xí)預(yù)測算法
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蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測是結(jié)構(gòu)生物學(xué)中的一個(gè)重要問題。針對八類蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測，提出了一種基于遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)和前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的深度學(xué)習(xí)預(yù)測算法。該算法通過雙向遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)建模氨基酸間的局部和長程相互作用，遞歸神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的隱層輸出進(jìn)一步送入到三層的前饋神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)以便進(jìn)行八類蛋白質(zhì)二級結(jié)構(gòu)預(yù)測。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，提出的算法在CB513數(shù)據(jù)集上達(dá)到了67.9%的Q8預(yù)測精度，顯著地優(yōu)于SSpr08和SC-CSN。
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