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如何用Python語(yǔ)法加速C+的數(shù)值計(jì)算

星星科技指導(dǎo)員 ? 來(lái)源:NVIDIA ? 作者:NVIDIA ? 2022-04-10 10:41 ? 次閱讀

Rob Smallshire 曾經(jīng)說(shuō)過(guò),“你可以在 C ++中編寫更快的代碼,但是在 Python 中編寫代碼更快。”自從它發(fā)布超過(guò)十年前, CUDA 已經(jīng)給 C 和 C ++程序員提供了在 Nvidia GPU 上最大化其代碼性能的能力。

最近, CuPy 和 PyTorch 等庫(kù)允許解釋語(yǔ)言的開(kāi)發(fā)人員利用其他語(yǔ)言優(yōu)化的 CUDA 庫(kù)的速度。這些解釋語(yǔ)言有許多優(yōu)秀的特性,包括易于閱讀的語(yǔ)法、自動(dòng)內(nèi)存管理和所有函數(shù)的通用類型。

然而,有時(shí)擁有這些功能意味著由于內(nèi)存管理和其他超出您控制范圍的因素而付出性能代價(jià)。為了節(jié)省開(kāi)發(fā)時(shí)間,性能的降低通常是值得的。不過(guò),當(dāng)性能成為一個(gè)問(wèn)題時(shí),它最終可能需要重寫應(yīng)用程序的某些部分。

如果你仍然可以使用 C ++來(lái)獲得最大的性能,同時(shí)仍然能從解釋語(yǔ)言中獲得所有好處呢?

MatX 概述

Matx 是一個(gè)實(shí)驗(yàn)性的 GPU 加速的數(shù)值計(jì)算 C ++庫(kù),旨在跨越用戶之間可能需要的最高性能之間的差距,在所有 CUDA 庫(kù)中使用相同的簡(jiǎn)單語(yǔ)法和類型。使用 CUDA 11.0 中添加的 C ++ 17 支持, MatX 允許您編寫與 Python 這樣的高級(jí)語(yǔ)言相同的自然代數(shù)表達(dá)式,而不會(huì)帶來(lái)性能損失。

張量類型

MatX 包括許多流行數(shù)學(xué)庫(kù)的接口,如 cuBLAS 、 CUTLASS 、 cuFFT 和 CUB ,但在所有這些庫(kù)中使用一種通用數(shù)據(jù)類型(tensor_t)。這大大簡(jiǎn)化了這些庫(kù)的 API ,方法是推斷出它知道的關(guān)于張量類型的信息,并在此基礎(chǔ)上調(diào)用正確的 API 。

下面的代碼示例顯示了一個(gè)基于 FFT 的重采樣器。

python

N = min(ns, ns_resamp)
nyq = N // 2 + 1 # Create an empty vector
sv = np.empty(ns) # Real to complex FFT
svc = np.fft.rfft(sv) # Slice
sv = svc[0:nyq] # Complex to real IFFT
rsv = np.fft.irfft(sv, ns_resamp)

馬特克斯

uint32_t N = std::min(ns, ns_resamp); uint32_t nyq = N / 2 + 1; auto sv = make_tensor({ns}); auto svc = make_tensor({ns / 2 + 1}); auto rv = make_tensor({ns_resamp}); // Real to complex FFT
fft(svc, sv, stream); // Slice the vector
auto sv = svc.Slice({0}, {nyq}); // Complex to real IFFT

ifft(rsv, sv, stream);雖然代碼長(zhǎng)度和可讀性相似,但 A100 上的 MatX 版本比 CPU 上運(yùn)行的 NumPy 版本快約 2100 倍。與直接使用 CUDA 庫(kù)相比, MatX 版本還有許多隱藏的好處,例如類型檢查、輸入和輸出大小檢查,以及在沒(méi)有指針操作的情況下切片張量。

不過(guò),張量類型并不限于 FFT ,同樣的變量也可以在其他庫(kù)和表達(dá)式中使用。例如,如果您想在重采樣器輸出上使用 Cutslass 執(zhí)行 GEMM ,可以編寫以下代碼:

matmul(resampOut, resampView, B, stream);

在這段代碼中, resampOut 和 B 是 GEMM 操作的適當(dāng)大小的張量。與前面的 FFT 示例一樣,類型、大小、批次和步幅都由張量元數(shù)據(jù)推斷。使用強(qiáng)類型的 C ++ API 也意味著許多運(yùn)行時(shí)和編譯時(shí)錯(cuò)誤可以在不進(jìn)行附加調(diào)試的情況下捕獲。

除了支持優(yōu)化的 CUDA 庫(kù)作為后端,這些相同的張量類型還可以用于代數(shù)表達(dá)式中,以執(zhí)行元素操作:

(C = A * B + (D / 5.0) + cos(E)).run(stream);

惰性評(píng)估

MatX 使用惰性計(jì)算在編譯時(shí)創(chuàng)建一個(gè) GPU 內(nèi)核,表示括號(hào)中的表達(dá)式。只有在表達(dá)式上調(diào)用 run 函數(shù)時(shí),操作才會(huì)在 GPU 上執(zhí)行。支持 40 多種不同類型的運(yùn)算符,可以在不同大小和類型的張量之間混合匹配,并具有兼容的參數(shù)。如果你看一下之前作為 CUDA 內(nèi)核編寫的表達(dá)式,它看起來(lái)像這樣:

__global__ void Expression( float *C, const float *A, const float *B, const float *D, const float *E, int length)
{ for (int idx = blockIdx.x * blockDim.x + threadIdx.x; idx < length; idx += blockDim.x * gridDim.x) { C[idx] = A[idx] * B[idx] + (D[idx] / 5.0) + cosf(E[idx]); }?

雖然前面的代碼并不復(fù)雜,但它隱藏了幾個(gè)問(wèn)題:

數(shù)據(jù)類型硬編碼為浮動(dòng)。要更改為其他類型,必須編輯內(nèi)核簽名。精明的讀者會(huì)說(shuō),使用模板,讓編譯器為您推斷類型。雖然這可能適用于某些類型,但并不適用于您可能想要使用的所有類型。例如, cosf 不是為半精度類型定義的,因此必須使用編譯時(shí)條件來(lái)處理不同的類型。

對(duì)函數(shù)簽名的任何微小更改都需要一個(gè)完全不同的函數(shù)。例如,如果您想在某些情況下添加張量 F ,但仍保留原始簽名,該怎么辦?這將是兩個(gè)幾乎相同的功能。

雖然 grid-stride loop 是一種很好的實(shí)踐,用于處理不同大小的塊和網(wǎng)格,但您仍然必須有代碼來(lái)確保在內(nèi)核啟動(dòng)期間有足夠的線程使 GPU 保持忙碌。

假設(shè)所有輸入為 1D 向量;更高的維度可能會(huì)隨著不統(tǒng)一的步伐而斷裂。

還有許多其他缺陷沒(méi)有列出,包括無(wú)法廣播不同大小的張量、不檢查大小、需要連續(xù)內(nèi)存布局等等。

顯然,這段代碼只在特定條件下工作,而 MatX 版本解決了所有這些問(wèn)題,而且通常保持與直接編寫內(nèi)核相同的性能。

附加 MatX 功能

MatX 的其他主要功能包括:

通過(guò)切片、克隆和置換現(xiàn)有張量創(chuàng)建零拷貝張量視圖。

支持任意維張量。

用于動(dòng)態(tài)生成數(shù)據(jù)的生成器,無(wú)需存儲(chǔ)在內(nèi)存中。常見(jiàn)的例子是創(chuàng)建線性間隔向量、漢明窗或?qū)蔷仃嚒?/p>

支持 CUDA 中使用的幾乎所有類型,包括半精度( FP16 和 BF16 )和復(fù)數(shù)(全精度和半精度)。

線性解算器通過(guò) cuSolver 、使用 CUB 進(jìn)行排序和掃描、使用 cuRAND 生成隨機(jī)數(shù)、減少等功能實(shí)現(xiàn)

總結(jié)

MatX 是根據(jù) BSDv3 許可證開(kāi)源的。

關(guān)于作者

Cliff Burdick 是 NVIDIA 的高級(jí)開(kāi)發(fā)技術(shù)工程師,他專注于優(yōu)化信號(hào)處理、數(shù)值計(jì)算以及 GPU 和網(wǎng)絡(luò) IO 的 GPU 代碼。

Justin Luitjens 是 NVIDIA 的高級(jí)開(kāi)發(fā)技術(shù)經(jīng)理,致力于加速 GPU 上的應(yīng)用程序。他擁有猶他大學(xué)的科學(xué)計(jì)算博士學(xué)位。

Adam Thompson 是 NVIDIA 的高級(jí)解決方案架構(gòu)師。他有信號(hào)處理方面的背景,他的職業(yè)生涯一直在參與和領(lǐng)導(dǎo)一些項(xiàng)目,這些項(xiàng)目專注于射頻分類、數(shù)據(jù)壓縮、高性能計(jì)算、統(tǒng)計(jì)信號(hào)處理以及管理和設(shè)計(jì)針對(duì)大數(shù)據(jù)框架的應(yīng)用程序。他擁有喬治亞理工大學(xué)電子與計(jì)算機(jī)工程碩士學(xué)位和克萊姆森大學(xué)學(xué)士學(xué)位。

審核編輯:郭婷

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