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Insilico Medicine通過(guò)人工智能識(shí)別ALS的治療靶點(diǎn)

星星科技指導(dǎo)員 ? 來(lái)源:NVIDIA ? 作者:Renee Yao ? 2022-10-10 11:57 ? 次閱讀
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藥物發(fā)現(xiàn)初創(chuàng)公司 Insilico Medicine 與來(lái)自哈佛醫(yī)學(xué)院、約翰霍普金斯醫(yī)學(xué)院、梅奧診所等的研究人員一起使用人工智能識(shí)別了二十多個(gè)與肌萎縮側(cè)索硬化癥( ALS )相關(guān)的基因靶點(diǎn)。研究結(jié)果包括 17 個(gè)高置信度和 11 個(gè)新的治療靶點(diǎn),最近發(fā)表在 衰老神經(jīng)科學(xué)前沿 上。

利用 Insilico 的人工智能驅(qū)動(dòng)的靶點(diǎn)發(fā)現(xiàn)引擎 PandaOmics ,研究人員分析了大量數(shù)據(jù)集,以發(fā)現(xiàn)新藥物可以靶向改善 ALS (也稱為 Lou Gehrig 病)預(yù)后的基因。如今,患者通常在癥狀出現(xiàn)后面臨 2 到 5 年的平均預(yù)期壽命。

研究團(tuán)隊(duì)使用 NVIDIA GPU 來(lái)訓(xùn)練用于目標(biāo)識(shí)別的深度學(xué)習(xí)模型。 PandaOmics 人工智能引擎使用組學(xué)人工智能分?jǐn)?shù)、基于文本的人工智能分?jǐn)?shù)、財(cái)務(wù)分?jǐn)?shù)等組合對(duì)基因目標(biāo)進(jìn)行排序。

ALS 是一種使人衰弱的疾病。患者迅速失去自主肌肉運(yùn)動(dòng),影響行走、說(shuō)話、進(jìn)食和呼吸的能力。美國(guó)食品和藥物管理局批準(zhǔn)的五種現(xiàn)有治療方法無(wú)法阻止或扭轉(zhuǎn)這種影響全球 70 多萬(wàn)人的功能喪失。

Insilico Medicine 創(chuàng)始人兼首席執(zhí)行官亞歷克斯·扎沃龍科夫( Alex Zhavoronkov )在一份 新聞發(fā)布 報(bào)告中說(shuō):“這項(xiàng)合作研究成果表明,當(dāng)我們將人類專業(yè)知識(shí)與人工智能工具結(jié)合起來(lái),發(fā)現(xiàn)未滿足需求的疾病的新靶點(diǎn)時(shí),這是可能的。”。“這只是開(kāi)始。”

Insilico Medicine 是 NVIDIA Inception 的首要成員, VZX5 是一個(gè)全球計(jì)劃,旨在支持具有共同營(yíng)銷(xiāo)、專業(yè)知識(shí)和技術(shù)的尖端創(chuàng)業(yè)公司。

人工智能揭示了治療無(wú)法治愈疾病的新途徑

研究團(tuán)隊(duì)使用分布式圖形學(xué)習(xí)庫(kù) Quiver 在多個(gè) NVIDIA GPU 上加速其人工智能模型。他們使用了自然語(yǔ)言處理模型,包括 生物 BERT , GPT 和 OPT ,以及文本識(shí)別模型,包括 PaddleOCR 和 docTR 。

為了幫助識(shí)別與肌萎縮側(cè)索硬化癥相關(guān)的基因,研究人員使用了公共數(shù)據(jù)集以及來(lái)自 Answer-ALS 的數(shù)據(jù), Answer-ALS 是一個(gè)全球項(xiàng)目,其臨床數(shù)據(jù)由約 1000 名肌萎縮側(cè)索硬化癥患者的 2.6 萬(wàn)億個(gè)數(shù)據(jù)點(diǎn)組成。在一個(gè)臨床前動(dòng)物模型中,該團(tuán)隊(duì)驗(yàn)證了 28 個(gè)已識(shí)別的基因靶點(diǎn)中的 18 個(gè)與肌萎縮側(cè)索硬化癥在功能上相關(guān),并且在其中 8 個(gè)靶點(diǎn)中,抑制將顯著減少神經(jīng)退行性變。

研究人員目前正在努力將其中一些目標(biāo)推向 ALS 的臨床試驗(yàn)。目標(biāo)將在 ALS.AI 上共享,以幫助加速藥物發(fā)現(xiàn)。

今年早些時(shí)候, Insilico 開(kāi)始了一項(xiàng)人工智能的 1 期臨床試驗(yàn),人工智能設(shè)計(jì)的藥物用于治療肺纖維化,這是另一種進(jìn)展迅速、難以治療的疾病。

關(guān)于作者

Renee Yao 是 NVIDIA 全球醫(yī)療 AI 創(chuàng)業(yè)公司的領(lǐng)導(dǎo)者,管理著 1300 多家數(shù)字健康、醫(yī)療器械、醫(yī)療成像、基因組學(xué)和藥物發(fā)現(xiàn)領(lǐng)域的醫(yī)療初創(chuàng)公司。此前,她曾在 NVIDIA 擔(dān)任人工智能系統(tǒng)的高級(jí)產(chǎn)品經(jīng)理和產(chǎn)品營(yíng)銷(xiāo)經(jīng)理,為自動(dòng)駕駛汽車(chē)、電信和大數(shù)據(jù)分析行業(yè)構(gòu)建捆綁解決方案和參考架構(gòu)。她畢業(yè)于加州大學(xué)伯克利分校哈斯商學(xué)院,主修經(jīng)濟(jì)學(xué)和信息技術(shù)。 Renee 被評(píng)為 B2B 產(chǎn)品營(yíng)銷(xiāo) 50 強(qiáng)之一。在空閑時(shí)間,她喜歡競(jìng)爭(zhēng)性的交際舞、閱讀和旅行。

審核編輯:郭婷

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