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利用深度學(xué)習(xí)來(lái)幫助眼科醫(yī)生和驗(yàn)光師進(jìn)一步檢測(cè)眼部圖像的新方法

nlfO_thejiangme ? 來(lái)源:未知 ? 作者:李倩 ? 2018-11-24 10:53 ? 次閱讀

青光眼是世界上導(dǎo)致失明的第二大原因。僅在美國(guó),這一病癥就影響了約270萬(wàn)人。它是一種復(fù)雜的疾病,如果不及時(shí)治療可能導(dǎo)致失明。這在澳大利亞也是個(gè)特別嚴(yán)重的問(wèn)題,其中只有50%的人被確診為青光眼并接受相應(yīng)的治療。

目前,IBM和紐約大學(xué)科學(xué)家團(tuán)隊(duì)正在研究,可以利用深度學(xué)習(xí)來(lái)幫助眼科醫(yī)生和驗(yàn)光師進(jìn)一步檢測(cè)眼部圖像的新方法,這一方法也可有助于加快在圖像中檢測(cè)青光眼的過(guò)程。

在最近的一篇論文中,研究人員詳細(xì)介紹了一種新的深度學(xué)習(xí)框架,該框架直接從原始光學(xué)相干斷層掃描(OCT)成像中檢測(cè)青光眼,這種方法利用的是光波拍攝視網(wǎng)膜的橫截面圖像。該方法達(dá)到了94%的準(zhǔn)確率,且無(wú)需對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行任何額外的分割或清理——通常在傳統(tǒng)的方法中這一步驟通常非常耗時(shí)。

青光眼(頂行)和健康眼(底行)中網(wǎng)絡(luò)檢測(cè)區(qū)域的可視化

現(xiàn)在,人們使用各種測(cè)試方法來(lái)診斷青光眼,例如眼壓測(cè)量和視野測(cè)試、眼底和OCT成像。但OCT提供了一種有效的方法來(lái)可視化和量化眼睛中的結(jié)構(gòu),即視網(wǎng)膜神經(jīng)纖維層(RNFL),它隨著疾病的進(jìn)展而變化。

雖然這種方法效果良好,但它需要額外的過(guò)程來(lái)量化OCT圖像中的視網(wǎng)膜神經(jīng)纖維層。這些技術(shù)通常需要配合各種方式來(lái)對(duì)輸入數(shù)據(jù)進(jìn)行處理,例如將所有眼睛圖片翻轉(zhuǎn)到相同的方向(左或右)以減少數(shù)據(jù)的可變性,從而改善分類(lèi)器的性能。而研究人員新提出的方法消除了這些額外的步驟,保留了檢測(cè)中最重要的部分。

在624名受試者(217名健康受試者和432名青光眼患者)中,研究人員建立了利用深度學(xué)習(xí)進(jìn)行檢測(cè)的新方法,準(zhǔn)確地檢測(cè)出了94%的青光眼患者,而之前提到的技術(shù)僅發(fā)現(xiàn)了86%的患者。研究人員表示準(zhǔn)確性的提升是由于對(duì)圖像中結(jié)構(gòu)自動(dòng)分割錯(cuò)誤的消除,以及新方法包含了目前臨床上尚未使用的眼底特征進(jìn)行了分類(lèi)。

此外,與目前使用更大更深層網(wǎng)絡(luò)的人工智能研究趨勢(shì)相反,研究人員使用的網(wǎng)絡(luò)是一個(gè)小型的5層網(wǎng)絡(luò),這主要是由于醫(yī)療數(shù)據(jù)由于其隱私性不易獲取。這種數(shù)據(jù)稀缺使得大型網(wǎng)絡(luò)的使用在許多醫(yī)療應(yīng)用中不切實(shí)際。即使在研究中有時(shí)也會(huì)看到“越少越佳”的特點(diǎn),此外,在較小的網(wǎng)絡(luò)上訓(xùn)練這些算法可以讓它們更高效地運(yùn)行。

數(shù)據(jù)被輸入如下圖所示的卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)(CNN)。網(wǎng)絡(luò)由5個(gè)3D卷積層組成,并使用ReLU激活和批量歸一化,濾波器組大小為32-32-32-32-32,濾波器尺寸為7-5-3-3-3,步幅為2-1-1-1-1。在最后的卷積層之后采用全局平均合并,并利用全連接的softmax輸出層以實(shí)現(xiàn)類(lèi)標(biāo)簽的預(yù)測(cè)和類(lèi)激活圖(CAM)的計(jì)算。網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)的一個(gè)重要方面是選擇3D卷積以允許計(jì)算3D類(lèi)激活圖。卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)的5個(gè)輸入層沿第一維度(例如,顏色通道)聚合輸入數(shù)據(jù)。在2D卷積的情況下,所得到的類(lèi)激活圖將是2D的,且深度信息丟失。因此通過(guò)采用3D卷積,這使我們能夠識(shí)別光學(xué)相干斷層掃描體積內(nèi)對(duì)疾病分類(lèi)很重要的區(qū)域。

通過(guò)隨機(jī)超參數(shù)探索優(yōu)化了網(wǎng)絡(luò)體系結(jié)構(gòu)的各個(gè)方面,例如層數(shù)、每層濾波器組數(shù)、濾波器大小、步幅和批量歸一化的使用;類(lèi)似于為基于特征的方法執(zhí)行的超參數(shù)優(yōu)化。網(wǎng)絡(luò)實(shí)現(xiàn)的曲線下面積用于選擇最佳網(wǎng)絡(luò)。研究人員從網(wǎng)絡(luò)架構(gòu)搜索中排除了最大池化,因?yàn)樗梢员籹tride卷積取代。

卷積神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)在Keras中實(shí)現(xiàn),Tensorflow作為后端。使用nut-flow/ml進(jìn)行數(shù)據(jù)分離、分層和預(yù)處理。通過(guò)降采樣,每個(gè)階段對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分層。通過(guò)隨機(jī)遮擋、平移、左右眼翻轉(zhuǎn)、沿著表面軸的小旋轉(zhuǎn)(±10度)和混合來(lái)增強(qiáng)訓(xùn)練數(shù)據(jù)。同時(shí)研究人員還在沒(méi)有任何擴(kuò)充的情況下訓(xùn)練了網(wǎng)絡(luò),并報(bào)告了相應(yīng)的曲線下面積。在訓(xùn)練期間具有最高準(zhǔn)確度的曲線下面積的網(wǎng)絡(luò)被保存。

這只是IBM目前研究應(yīng)用人工智能的一個(gè)方面。在最近宣布的新合作中,IBM Research和George&Matilda (G&M) 將利用G&M強(qiáng)大的匿名臨床數(shù)據(jù)和成像研究數(shù)據(jù)集,來(lái)探索使用深度學(xué)習(xí)模型和成像分析的方法,以支持臨床醫(yī)生在圖像中識(shí)別和檢測(cè)眼部疾病——包括青光眼。研究人員還將研究青光眼的潛在生物標(biāo)志物,這有助于更好地了解疾病進(jìn)展。

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原文標(biāo)題:治愈系 | 深度學(xué)習(xí) & 青光眼

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