資料介紹
蛋白質是執行生物體內各種重要生物活動的大分子,認識其功能對推動生命科學、農業、醫療等領域的發展意義重大。1961年,Anfinsen等提出蛋白質一級序列決定其三維結構、蛋白質三維結構決定其功能的論斷。相對于蛋白質三維結構,一級序列更容易通過生物實驗測得,故早期的蛋白質功能預測方法大都基于序列相似性原理,利用BLAST( Basic Local Alignment Search Tool)和 PSI-BLAST(Position-Specific Iterated BLAST)等工具計算功能未知的蛋白質與功能已知的蛋白質之間的序列相似度,若相似度較高則認為其具有相同的功能。然而,近年來的研究表明,序列相似的蛋白質能夠形成不同的三維結構,故其功能不一定相同,而且序列差異較大的蛋白質也可能具有相同的功能;因此,基于序列相似性的蛋白質功能預測方法是不可靠的。
針對現有的基于蛋白質相互作用( PPI)網絡的蛋白質功能預測方法預測精度不高、易受數據噪聲影響的問題,提出一種基于機器學習(層次聚類、主成分分析和多層感知器)的蛋白質功能預測方法HPMM。該方法綜合考慮蛋白質宏觀和微觀層面的信息,將蛋白質家族、結構域和重要位點信息作為頂點屬性整合到PPI網絡中以減輕網絡中數據噪聲的影響。首先,基于層次聚類和主成分分析進行特征提取,得到功能模塊和屬性主成分特征,然后訓練多層感知器模型,建立多特征與多功能之間的映射關系以用于功能預測。在三個分別被分子功能( MF)、生物過程(BP)和細胞組件( CC)注釋的人類PPI網絡上進行測試,對HPMM、余弦迭代算法(CIA)和有向PPI網絡基因本體術語傳播( GoDIN)算法的功能預測效果進行比較分析。實驗結果表明,相比CIA和GoDIN這兩種完全基于PPI網絡的方法,HPMM的精確度與F值更高。
- 基于衰減系數的動態蛋白質預測網絡模型 10次下載
- 基于CNN和LSTM的蛋白質亞細胞定位研究對比 15次下載
- 蛋白質能量模型的多模態優化算法綜述 1次下載
- 基于聚類與特征融合的蛋白質亞細胞定位方法 5次下載
- 結合CSPPNet與集成學習的人類蛋白質圖像分類 4次下載
- 一種改進的動態蛋白質網絡構建算法 2次下載
- 如何使用機器學習技術解決社會網絡鏈接預測問題 20次下載
- 基于基因本體和核附屬的蛋白質復合物識別算法 3次下載
- 機器學習和線性隨機效應混合模型在縱向數據預測上的對比 0次下載
- 基于集成多標記學習的蛋白質多亞細胞定位預測方法 0次下載
- 使用NTA或者抗組胺抗體捕獲組氨酸標記的蛋白質 29次下載
- 分離肽和蛋白質色譜柱的維護
- 貝葉斯方法在蛋白質耐熱性分類中的研究
- 氧化還原蛋白質電化學研究
- 基于改進的禁忌搜索的蛋白質三維結構預測
- 差示掃描量熱儀在食品行業的應用 91次閱讀
- 用一篇20+文獻帶你領略修飾組學的魅力 1138次閱讀
- 基于精準聚焦目標空間區域的轉錄組和蛋白質組一站式解決方案 1017次閱讀
- CDPro技術可實現微量血液中蛋白的超靈敏檢測 886次閱讀
- LasergeneProtein工作流程 732次閱讀
- 圖數據切分與模型數據載入的問題解析 549次閱讀
- 基于OpenAI的GPT-2的語言模型ProtGPT2可生成新的蛋白質序列 1994次閱讀
- 一圖在手,機器學習、神經網絡、數據科學要點都有 2409次閱讀
- 如何同時使用Nucleus與TensorFlow解決基因組學領域的機器學習問題 3918次閱讀
- DeepMind方案:基于深度神經網絡 2862次閱讀
- DeepMind推出的AI工具AlphaFold以優異成績碾壓了人類專家 2763次閱讀
- 機器學習技術帶你領略重要的生物醫學發現 3473次閱讀
- 機器學習預測世界杯的結果你相信嗎?機器學習的應用 5176次閱讀
- 納米機器人未來或許會成為最安全有效的解毒方式 7075次閱讀
- 如何開始接觸機器學習_機器學習入門方法盤點 4093次閱讀
下載排行
本周
- 1DC電源插座圖紙
- 0.67 MB | 2次下載 | 免費
- 2AN158 GD32VW553 Wi-Fi開發指南
- 1.51MB | 2次下載 | 免費
- 3AN148 GD32VW553射頻硬件開發指南
- 2.07MB | 1次下載 | 免費
- 4AN111-LTC3219用戶指南
- 84.32KB | 次下載 | 免費
- 5AN153-用于電源系統管理的Linduino
- 1.38MB | 次下載 | 免費
- 6AN-283: Σ-Δ型ADC和DAC[中文版]
- 677.86KB | 次下載 | 免費
- 7SM2018E 支持可控硅調光線性恒流控制芯片
- 402.24 KB | 次下載 | 免費
- 8AN-1308: 電流檢測放大器共模階躍響應
- 545.42KB | 次下載 | 免費
本月
- 1ADI高性能電源管理解決方案
- 2.43 MB | 450次下載 | 免費
- 2免費開源CC3D飛控資料(電路圖&PCB源文件、BOM、
- 5.67 MB | 138次下載 | 1 積分
- 3基于STM32單片機智能手環心率計步器體溫顯示設計
- 0.10 MB | 130次下載 | 免費
- 4使用單片機實現七人表決器的程序和仿真資料免費下載
- 2.96 MB | 44次下載 | 免費
- 53314A函數發生器維修手冊
- 16.30 MB | 31次下載 | 免費
- 6美的電磁爐維修手冊大全
- 1.56 MB | 24次下載 | 5 積分
- 7如何正確測試電源的紋波
- 0.36 MB | 17次下載 | 免費
- 8感應筆電路圖
- 0.06 MB | 10次下載 | 免費
總榜
- 1matlab軟件下載入口
- 未知 | 935121次下載 | 10 積分
- 2開源硬件-PMP21529.1-4 開關降壓/升壓雙向直流/直流轉換器 PCB layout 設計
- 1.48MB | 420062次下載 | 10 積分
- 3Altium DXP2002下載入口
- 未知 | 233088次下載 | 10 積分
- 4電路仿真軟件multisim 10.0免費下載
- 340992 | 191367次下載 | 10 積分
- 5十天學會AVR單片機與C語言視頻教程 下載
- 158M | 183335次下載 | 10 積分
- 6labview8.5下載
- 未知 | 81581次下載 | 10 積分
- 7Keil工具MDK-Arm免費下載
- 0.02 MB | 73810次下載 | 10 積分
- 8LabVIEW 8.6下載
- 未知 | 65988次下載 | 10 積分
評論