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數(shù)字化服務提供商榮聯(lián)與天津海關共建基因組數(shù)據(jù)庫及分析平臺

電子行業(yè)新聞 ? 來源:電子行業(yè)新聞 ? 作者:電子行業(yè)新聞 ? 2022-06-24 12:24 ? 次閱讀
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快速準確的鑒定物種一直是基因組進化和物種鑒別中的一大挑戰(zhàn),在海關口岸業(yè)務中,瀕危動植物制成品形態(tài)多樣,物種鑒別困難,口岸生物安全防控形勢更加嚴峻,進一步強化海關物種鑒定能力、提升基因信息分析效率成為科技興關的重要舉措。

立足口岸業(yè)務需求,圍繞海關業(yè)務發(fā)展方向,以瀕危物種、植物轉基因數(shù)據(jù)庫為切入點,榮聯(lián)科技集團與天津海關達成戰(zhàn)略合作協(xié)議,結合各自在基因組學研究領域的技術優(yōu)勢及行業(yè)積累,共同搭建了海關動植物基因組數(shù)據(jù)庫及分析平臺。

平臺建成后,將全力支持天津海關進行瀕危物種和轉基因植物基因組序列分析鑒定,全面助力海關打擊夾帶及非法瀕危物種產制品貿易、轉基因序列來源確定、合法性鑒定、未知轉基因品系探究等重點工作。

海關基因組數(shù)據(jù)庫 構建中國的生物遺傳物質數(shù)據(jù)長城

為更高效、準確的挖掘基因組數(shù)據(jù)價值,榮聯(lián)與天津海關建設中國海關基因組數(shù)據(jù)庫,構建中國的生物遺傳物質數(shù)據(jù)長城。該數(shù)據(jù)庫支持轉基因植物、瀕危動植物等物種基因組的數(shù)據(jù)存儲和聚合查詢,可完美應對數(shù)據(jù)類型不一、數(shù)據(jù)種類多、數(shù)據(jù)量大等難題。

海關基因組數(shù)據(jù)分析平臺中基礎數(shù)據(jù)庫包括瀕危動植物、轉基因植物數(shù)據(jù)庫,可實現(xiàn)對多源基因組數(shù)據(jù)的收集、治理、匯總和統(tǒng)一管理,能夠支持依據(jù)海量數(shù)據(jù)的數(shù)據(jù)特征進行高效的組織和索引。同時,能夠滿足在瀕危動植物、轉基因植物數(shù)據(jù)庫基礎上擴展物種主題庫的未來業(yè)務發(fā)展需求。

系統(tǒng)可實現(xiàn)秒級響應,數(shù)十用戶同時使用,檢索成功率可超過99%,大力提升海關檢驗技術人員的工作效率。

基因信息全自動分析平臺 一鍵操作

基因信息全自動分析平臺包括分析平臺引擎和可視化生物信息學分析工作流,該平臺可實現(xiàn)容器管理、流程管理、工具管理、監(jiān)控管理、資源池管理、用戶管理、日志管理、配置管理、鏡像管理等,并支持一體化、自動化基因數(shù)據(jù)分析和計算、存儲、樣本測序數(shù)據(jù)管理等服務,可按需對平臺提供計算、存儲資源支持。

傳統(tǒng)的基因組學測序數(shù)據(jù)分析流程涉及多種編程語言,流程維護難度極大。此項目采用Docker技術,將數(shù)據(jù)分析流程分為若干模塊進行封裝,細化流程顆粒度,提高開源分析模塊算法更新的便捷度,并使用多種國際通用的工作流描述語言重構分析流程,縮短流程維護的周期。同時采用分布式調度方式,并行、彈性調用計算資源,大幅降低流程維護難度。

基因數(shù)據(jù)分析平臺進一步簡化了基因數(shù)據(jù)分析操作,流程可視化編排便利了檢測技術人員數(shù)據(jù)分析操作,一鍵操作即可實現(xiàn)基因數(shù)據(jù)分析。以物種鑒定為例,使用人員可通過web瀏覽器登錄基因信息全自動分析平臺,導入待鑒定樣本測序數(shù)據(jù),可視化勾選數(shù)據(jù)分析流程,對數(shù)據(jù)進行一鍵式分析,即可拿到鑒定參考分析報告,準確性高達99.9%。

榮聯(lián)與天津海關充分發(fā)揮在數(shù)據(jù)整合、數(shù)據(jù)挖掘、生物信息學分析引擎等領域的技術優(yōu)勢,借助信息技術建立物種鑒定生物信息分析流,形成基因測序數(shù)據(jù)分析算法實現(xiàn)物種信息鑒別,大幅提高物種鑒別速度和精度。

項目實施過程中建立的基因測序數(shù)據(jù)分析方法,為基因檢測原始數(shù)據(jù)計算、分析等服務提供信息化平臺建設參考,并支持孵化全國海關可實施、可推廣的創(chuàng)新性實用產品。項目中建立的系列具有自主知識產權和核心技術的標準化基因數(shù)據(jù)分析平臺及基因大數(shù)據(jù)庫,輔助實現(xiàn)了口岸高通量快速精準探測、覆蓋生物安全風險防控的需求,成為口岸生物安全防控研究創(chuàng)新的源頭支撐。

截至目前,該項目已完成瀕危物種轉基因植物兩個方向的物種信息數(shù)據(jù)庫的建立,全面實現(xiàn)數(shù)據(jù)庫的可視化,并完成了基于數(shù)據(jù)庫的基因信息全自動分析平臺和分析流程的開發(fā)和調試。

作為國內領先的數(shù)字化服務提供商,榮聯(lián)堅持科技助力行業(yè)發(fā)展,與天津海關深入合作,持續(xù)為口岸瀕危物種走私、非法轉基因產品等國門生物安全防控提供有力支撐。

聲明:本文內容及配圖由入駐作者撰寫或者入駐合作網站授權轉載。文章觀點僅代表作者本人,不代表電子發(fā)燒友網立場。文章及其配圖僅供工程師學習之用,如有內容侵權或者其他違規(guī)問題,請聯(lián)系本站處理。 舉報投訴
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