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探測蛋白質微晶的3D結構

IEEE電氣電子工程師 ? 來源:未知 ? 作者:李倩 ? 2018-10-26 14:14 ? 次閱讀
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原子級分辨率:該設施是專門設計來幫助科學家們研究那些不超過1微米的生物分子和單個粒子的。

European XFEL(或稱EuXFEL)——目前世界上最大的X射線自由電子激光器[1]——于2017年5月制造出了第一束激光脈沖。該設施建于德國漢堡附近一條長達3.4公里的隧道內,于去年9月正式投入使用。2018年8月,第一篇基于利用它進行的實驗撰寫的科學論文[2]發表,這是該設施的另一個里程碑式事件。在這篇論文中,作者們使用它來探測蛋白質微晶的3D結構。

當該設施達到全面運行狀態時,肯定會產出更多的研究成果。已經有來自20個國家的500多名研究人員訪問了該設施,以研究晶體材料、生物分子、病毒的結構和化學反應。目前有2個實驗站可供科學界使用,但到2019年,該設施將有6個提供來自3個X射線激光器的脈沖的實驗站。當前設計里的冷卻要求限制了它每秒發送不超過27,000個脈沖,但研究人員設想使其能發送連續的脈沖流。

在EuXFEL中,電子首先通過一個直線加速器,該加速器安裝在一條2.1公里長的隧道中,并裝有超導腔。無線電波在這些超導腔內產生交替的正負電場。電子被匯集成束,在電場為正時進入每個空腔。注入第一腔的電子得到加速后進入第二腔。每個新腔都能為電子提供能量。

能量高達17.5千兆電子伏特(GeV)的電子從加速器中射出,并被注入三個由一系列永磁體組成的所謂的振蕩器中。磁體具有交替變換的極性,這會迫使電子在穿過磁體兩極之間的間隙時沿著彎曲的正弦曲線路徑行進。每當一個電子從其路徑偏離時,它就會發出輻射。然后,在每個磁體處產生的X射線波向前傳播,并與來自所有其他磁體的波結合,產生相干的、針樣尖細的脈沖束。

超導腔允許加速器一次加速多達27,000束電子,這些電子束在波蕩器中產生相同數量的X射線脈沖,并產生極高分辨率的光束。由于如此快速地產生如此多的脈沖,研究人員可以實時跟蹤化學反應和分子間的相互作用。

EuXFEL常務董事Robert Feidenhans'l說:“高重復率是我們的優勢?!盓uXFEL為每個實驗產生的數據比任何其他X射線自由電子激光器(比如位于斯坦福大學的美國能源部的直線加速器相干光源LCLS[3])產生的都多。這使得EuXFEL更適用于做小而復雜的生物結構(如蛋白質)的研究。

例如,當被X射線脈沖轟擊時,分子可以形成衍射圖案,但是脈沖會破壞分子。因此,為了研究分子的結構,科學家們必須通過將新的、未受損的分子嵌入穿過X射線路徑的液體流中,不斷地向脈沖提供新的、未受損的分子。

歐洲、澳大利亞和美國的研究人員使用了這種方法,他們在8月份發表了關于蛋白質的這第一篇論文。他們將尿素酶(存在于植物種子和動物組織中的一種酶)和在刀豆中發現的另外兩種蛋白質混合到液體中,并將其噴射到激光的路徑上。脈沖不斷撞擊新的微晶,并收集其中許多微晶的衍射圖案,使研究人員得以重建刀豆蛋白質的晶體結構。

這種方法還可以讓科學家們創造出“分子電影”——通過記錄單個原子的運動來展示原子在化學反應中的行為,或者讓科學家們可以去研究液體射流中存在的病毒的行為。

羅格斯大學的物理學家、這篇微晶論文的共同作者Claudiu Stan說,EuXFEL的高重復率也加快了實驗速度,并允許更多的研究人員使用該設施。LCLS每秒發送120個脈沖,脈沖之間的間隔是8毫秒。而EuXFEL每秒可以產生100萬個脈沖,盡管它在快速爆發時每秒發送的脈沖不能超過27,000個。在這些爆發期間,脈沖之間的間隔是222納秒。

自由電子激光科學中心(位于漢堡)的研究者Anton Barty于2017年9月在EuXFEL領導了第一個實驗。該實驗為利用該設備所進行的研究所產出的第二篇論文[4]提供了數據?!皬募铀倨鞯?a target="_blank">探測器,涉及到如此多的新技術,以至于我們認為會有地方出問題。然而令人驚訝的是,我們從第一周起就得到了可公布的結果?!彼貞浾f。

除探索蛋白質結構外,EuXFEL還將幫助研究人員研究極端條件下物質的結構,以及物質暴露于極強磁場時的表現。Feidenhans’l說:“在這些條件下研究超導和電子材料,將是非常有趣的?!?/p>

LCLS-II

位于斯坦福大學SLAC國家加速器實驗室的LCLS是世界上第一臺產生X射線脈沖的激光器。LCLS于2012年上線,每秒發送120個脈沖,在2017年,European XFEL問世之前,它是同類型中最強大的設備。不過,到2020年,European XFEL又會被LCLS的繼任者LCLS-II超越LCLS-II的能力有望開啟化學反應、生物化學、材料科學和固態物理研究的新紀元。

了解一下LCLS-II:

每秒產生100萬個脈沖

產生的X射線激光束的亮度是LCLS的10,000倍

將可調諧光子能量范圍擴展到25千電子伏特

預計將于2020年下半年開始首次投入使用

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原文標題:EuXFEL開始顯示其價值:科學家們使用它揭示了最小蛋白質的結構

文章出處:【微信號:IEEE_China,微信公眾號:IEEE電氣電子工程師】歡迎添加關注!文章轉載請注明出處。

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