據(jù)麥姆斯咨詢報道，分離活的菌種往往是一個充滿挑戰(zhàn)的過程。因此，大部分微生物被認為是“不可培養(yǎng)的”。然而，人們越來越認識到，許多微生物可以通過使用新的生長工具和方法進行培養(yǎng)。我們與Biomillenia公司首席執(zhí)行官（CEO）Dirk L?ffert博士進行了對話，了解它們的微生物芯片技術如何克服活菌分離的挑戰(zhàn)，并“解鎖”傳說中不可培養(yǎng)的微生物，從而使其適用于一系列應用。

Biomillenia公司首席執(zhí)行官（CEO）Dirk Loffert博士Anna MacDonald（以下簡稱AM）：培養(yǎng)和分離活的菌種有哪些挑戰(zhàn)？Dirk Loffert（以下簡稱DL）：許多菌種由于無法在實驗室條件下復制，因此很難進行活體分離。通常，分離活的菌株需要對生長培養(yǎng)基和生長參數(shù)進行漫長而繁瑣的優(yōu)化，即使這樣也只能從環(huán)境或人體樣本中分離出少量的菌株。這被稱為微生物世界的“暗物質(zhì)”。AM：您能否和我們分享Biomellenia公司的微生物芯片技術，它又是如何改善上述過程的？DL：Biomillenia公司的芯片實驗室使用了1億個小液滴（每個20 pl），為細菌和其它類細胞或微生物提供獨特的生長環(huán)境。這使得我們可以從單細胞開始培養(yǎng)細菌，而不是像在標準微生物學方法中那樣，大量培養(yǎng)或在瓊脂平板上培養(yǎng)細胞。因此，我們可以確定一個適當?shù)纳L環(huán)境，細菌在這個環(huán)境下不需要和其它微生物競爭營養(yǎng)和必要的協(xié)同因子。此外，細菌可能會分泌抑制其它細胞的物質(zhì)。當我們將每種細菌封閉在一個受限制的生長空間內(nèi)時，我們也去除了這種影響細菌生長的抑制效應。Biomillenia技術平臺的另一大重要優(yōu)勢是能夠以同樣大的吞吐量（1億個液滴），在液滴環(huán)境中進行一系列不同的試驗。因此，我們不會局限于繁瑣的生長優(yōu)化，而是希望少數(shù)的分離菌株能夠適應所選擇的試驗條件，以分離候選產(chǎn)品。相比之下，我們進行了數(shù)百萬個平行培養(yǎng)試驗，并且可以用指定的試驗方法直接檢測，從龐大的人體微生物群落（或其它環(huán)境）中，一步選擇出有益的候選產(chǎn)品。

AM：這項技術未來將對診斷和環(huán)境監(jiān)測等應用造成何種影響？DL：依靠破壞細胞的分子生物學，目前也存在其它診斷和環(huán)境監(jiān)測技術，并且在許多情況下都適用。然而，我們技術平臺的最大優(yōu)勢，是能夠選擇我們所想要的特定特征來分離獲得活體菌種。這將為人類健康和營養(yǎng)、制藥應用和其它領域的產(chǎn)品開發(fā)提供全新機遇，借助于此，可以更好地獲得相關候選產(chǎn)品，更輕松分析對其有益的作用方式。AM：你能詳細給我們描述最近與荷蘭凱杰（QIAGEN）之間的合作嘛？此次合作又將打開怎樣雙贏的局面呢？DL：盡管下一代測序是一項非常成熟的技術，它已經(jīng)徹底改變了我們?nèi)绾卧诟敿毜姆肿铀綄用嫒シ治鑫⑸锶?，但?shù)據(jù)分析依然存在重大障礙。尤其是當需要分析具有很高基因組同源性的菌株時，目前的組裝算法還需要進一步完善并優(yōu)化。為不同的樣本類型開發(fā)參考數(shù)據(jù)庫，是另一大主要需求。基于凱杰行業(yè)領先的平臺技術，將顯著促進產(chǎn)品開發(fā)中生物信息學工作流的標準化和易用性，幫助我們的數(shù)據(jù)分析變成一個非常高效的過程。我們將在該領域不斷進行深入合作。AM：針對公司未來，你有什么發(fā)展計劃？DL：我們正在積極參與各種合作項目，為農(nóng)業(yè)中的產(chǎn)品開發(fā)分離新型菌株，在其它市場領域也在進行相類似的探討。Biomillenia公司專注于人類健康和營養(yǎng)產(chǎn)品的開發(fā)，幫助預防由生態(tài)失調(diào)所引起的生活方式類疾病和人體微生物群失衡。我們的平臺使我們能夠進行微生物分離，并分析微生物數(shù)量不足或缺失所帶來的有益影響，以改善人體健康狀況。